AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-21 | MiGA Online

skip navigation

AAI-based medoid clustering

The AAI clusters provide a good overview of the above-species structure of the datasets and facilitate taxonomic classification.

AAI clade 1 medoid: human MGYG000000946
AAI clade 2 medoid: human MGYG000000019
AAI clade 3 medoid: human MGYG000003370
AAI clade 4 medoid: 3300027323 37
AAI clade 5 medoid: human MGYG000004185
AAI clade 6 medoid: human MGYG000001010
AAI clade 7 medoid: wastewater GEMS 3300025861 51
AAI clade 8 medoid: human MGYG000002603
AAI clade 9 medoid: 3300024953 8
AAI clade 10 medoid: 3300017423 5
AAI clade 11 medoid: pig GCA 946405745 1
- AAI clade 11-1 medoid: pig GCA 946405745 1
  - AAI clade 11-1-1 medoid: pig GCA 946405745 1
    
    AAI clade 11-1-1-1 medoid: pig GCA 946405745 1
    
    AAI clade 11-1-1-1-1 medoid: pig GCA 946405745 1
    
    AAI clade 11-1-1-1-1-1 medoid: pig GCA 946405745 1
    
    AAI clade 11-1-1-1-1-1-1 medoid: pig GCA 946405745 1
    
    AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1 medoid: pig GCA 946405745 1
    
    AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-1 medoid: pig GCA 946405745 1
    
    AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-1-1 medoid: pig GCA 946405745 1
    
    AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1 medoid: pig GCA 946405745 1
    
    AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1 medoid: human MGYG000000048
    
    AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2 medoid: human MGYG000001513
    
    AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-3 medoid: human MGYG000001794
    
    AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-4 medoid: 3300006192 13
    
    AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-5 medoid: 3300009083 71
    
    AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-6 medoid: 3300012531 11
    
    AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-7 medoid: 3300013129 52
    
    AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-8 medoid: 3300017490 4
    
    AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-9 medoid: 3300017494 22
    
    AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-10 medoid: 3300017532 8
    
    AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-11 medoid: 3300021509 12
    
    AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-12 medoid: 3300029897 11
    
    AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-13 medoid: pig GCA 946405745 1
    
    AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-14 medoid: chicken MGYG000312581
    
    AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-15 medoid: human MGYG000001479
    
    AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-16 medoid: human MGYG000001610
    
    AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-17 medoid: ruminant GCA 015058325 1
    
    AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-18 medoid: human MGYG000002938
    
    AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-19 medoid: pig BL unmapped bin 73
    
    AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-20 medoid: pig QHF6 unmapped bin 566
    
    AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-21 medoid: ruminant GCA 015056475 1
    
    1 dataset: ruminant GCA 015056475 1 (AAI: 100.0%)
    
    AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-22 medoid: ruminant GCA 015058375 1
    
    AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-23 medoid: wastewater GEMS 3300001095 22
    
    AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-24 medoid: wastewater GEMS 3300009769 43
    
    AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-25 medoid: wastewater GEMS 3300025408 8
    
    AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-26 medoid: wastewater GEMS 3300025618 31
    
    AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2 medoid: 3300014203 44
    
    AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-1-1-3 medoid: 3300022227 62
    
    AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-1-1-4 medoid: 3300026519 68
    
    AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-1-2 medoid: 3300013131 77
    
    AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-1-3 medoid: 3300017494 73
    
    AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-2 medoid: 3300012952 13
    
    AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-3 medoid: 3300018018 17
    
    AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-4 medoid: wastewater GEMS 3300000558 32
    
    AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-2 medoid: 3300000234 54
    
    AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-3 medoid: 3300009084 136
    
    AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-4 medoid: 3300024433 41
    
    AAI clade 11-1-1-1-1-1-2 medoid: wastewater ye ASMAG630
    
    AAI clade 11-1-1-1-1-2 medoid: 3300013138 179
    
    AAI clade 11-1-1-1-1-3 medoid: 3300021488 7
    
    AAI clade 11-1-1-1-1-4 medoid: 3300027897 120
    
    AAI clade 11-1-1-1-1-5 medoid: wastewater singleton GCA 016699795 1 ASM1669979v1 genomic
    
    AAI clade 11-1-1-1-2 medoid: human MGYG000002377
    
    AAI clade 11-1-1-1-3 medoid: pig BL unmapped bin 291
    
    AAI clade 11-1-1-1-4 medoid: 3300000227 21
    
    AAI clade 11-1-1-1-5 medoid: wastewater ye ASMAG1121
    
    AAI clade 11-1-1-1-6 medoid: 3300021376 78
    
    AAI clade 11-1-1-1-7 medoid: 3300027896 132
    
    AAI clade 11-1-1-1-8 medoid: chicken GCA 019120235 1
    
    AAI clade 11-1-1-1-9 medoid: chicken MGYG000308692
    
    AAI clade 11-1-1-1-10 medoid: human MGYG000000115
    
    AAI clade 11-1-1-1-11 medoid: ruminant GCA 015068615 1
    
    AAI clade 11-1-1-1-12 medoid: wastewater GEMS 3300025748 62
    
    AAI clade 11-1-1-1-13 medoid: wastewater ye ASMAG205
    
    AAI clade 11-1-1-2 medoid: wastewater GEMS 3300028570 31
    
    AAI clade 11-1-1-3 medoid: wastewater ye ASMAG1884
    
    AAI clade 11-1-1-4 medoid: human MGYG000001276
    
    AAI clade 11-1-1-5 medoid: wastewater GEMS 3300028622 26
    
    AAI clade 11-1-1-6 medoid: wastewater GEMS 3300001095 19
    
    AAI clade 11-1-1-7 medoid: wastewater GEMS 3300025855 140
    
    AAI clade 11-1-1-8 medoid: 3300027896 119
    
    AAI clade 11-1-1-9 medoid: human MGYG000003801
    
    AAI clade 11-1-1-10 medoid: wastewater ye ASMAG1304
  - AAI clade 11-1-2 medoid: cow GCA 026651005 1
  - AAI clade 11-1-3 medoid: human MGYG000001309
  - AAI clade 11-1-4 medoid: human MGYG000003550
  - AAI clade 11-1-5 medoid: wastewater ye ASMAG368
- AAI clade 11-2 medoid: human MGYG000002486
- AAI clade 11-3 medoid: human MGYG000003114
- AAI clade 11-4 medoid: pig MGYG000302445
- AAI clade 11-5 medoid: dog SAMEA103957793 metabat2 high PE 001
- AAI clade 11-6 medoid: chicken MHCFR05601 metabat2 low PE 003
- AAI clade 11-7 medoid: pig QHF6 unmapped bin 170
- AAI clade 11-8 medoid: chicken DSLFR04102 metabat2 low PE 033
- AAI clade 11-9 medoid: pig LW1 s150971 bin 26
- AAI clade 11-10 medoid: chicken MGYG000315728
- AAI clade 11-11 medoid: human MGYG000002887
- AAI clade 11-12 medoid: pig F5110 bin 54
- AAI clade 11-13 medoid: human MGYG000001535
- AAI clade 11-14 medoid: 3300024353 70
- AAI clade 11-15 medoid: human MGYG000003150
- AAI clade 11-16 medoid: 3300013132 34
- AAI clade 11-17 medoid: human MGYG000002821
- AAI clade 11-18 medoid: human MGYG000002901
- AAI clade 11-19 medoid: human MGYG000001350
AAI clade 12 medoid: 3300006192 20
AAI clade 13 medoid: pig LW1 s150947 bin 23
AAI clade 14 medoid: dog Snoopy p1 metabat2 high PE 009
AAI clade 15 medoid: pig MGYG000302081
AAI clade 16 medoid: human MGYG000000545
AAI clade 17 medoid: human MGYG000003895
AAI clade 18 medoid: chicken MGYG000313561
AAI clade 19 medoid: 3300024912 1
AAI clade 20 medoid: human MGYG000002619
AAI clade 21 medoid: human MGYG000002428
AAI clade 22 medoid: 3300027805 13
AAI clade 23 medoid: chicken MGYG000314833
AAI clade 24 medoid: wastewater GEMS 3300027794 31
AAI clade 25 medoid: human MGYG000004406
AAI clade 26 medoid: pig MGYG000301788
AAI clade 27 medoid: 3300027834 52
AAI clade 28 medoid: 3300020389 13
AAI clade 29 medoid: 3300027835 270
AAI clade 30 medoid: 3300013004 97
AAI clade 31 medoid: 3300025065 6
AAI clade 32 medoid: human MGYG000004800
AAI clade 33 medoid: ruminant GCA 015060255 1
AAI clade 34 medoid: chicken GCA 019115885 1
AAI clade 35 medoid: pig SAMEA3663026 metabat2 high PE 017
AAI clade 36 medoid: human MGYG000000998
AAI clade 37 medoid: 3300012919 27
AAI clade 38 medoid: 3300027851 42
AAI clade 39 medoid: wastewater ye ASMAG566

A collaboration between