AAI-based medoid clustering
The AAI clusters provide a good overview of the above-species structure of the datasets and facilitate taxonomic classification.
-
AAI clade 1
medoid: human MGYG000000946
-
AAI clade 2
medoid: human MGYG000000019
-
AAI clade 3
medoid: human MGYG000003370
-
AAI clade 4
medoid: 3300027323 37
-
AAI clade 5
medoid: human MGYG000004185
-
AAI clade 6
medoid: human MGYG000001010
-
AAI clade 7
medoid: wastewater GEMS 3300025861 51
-
AAI clade 8
medoid: human MGYG000002603
-
AAI clade 9
medoid: 3300024953 8
-
AAI clade 10
medoid: 3300017423 5
-
AAI clade 11
medoid: pig GCA 946405745 1
-
AAI clade 11-1
medoid: pig GCA 946405745 1
-
AAI clade 11-1-1
medoid: pig GCA 946405745 1
-
AAI clade 11-1-1-1
medoid: pig GCA 946405745 1
-
AAI clade 11-1-1-1-1
medoid: pig GCA 946405745 1
-
AAI clade 11-1-1-1-1-1
medoid: pig GCA 946405745 1
-
AAI clade 11-1-1-1-1-1-1
medoid: pig GCA 946405745 1
-
AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1
medoid: pig GCA 946405745 1
-
AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-1
medoid: pig GCA 946405745 1
-
AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-1-1
medoid: pig GCA 946405745 1
-
AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1
medoid: pig GCA 946405745 1
-
AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1
medoid: human MGYG000000048
-
AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2
medoid: human MGYG000001513
-
AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-3
medoid: human MGYG000001794
-
AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-4
medoid: 3300006192 13
-
AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-5
medoid: 3300009083 71
-
AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-6
medoid: 3300012531 11
-
AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-7
medoid: 3300013129 52
-
AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-8
medoid: 3300017490 4
-
AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-9
medoid: 3300017494 22
-
AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-10
medoid: 3300017532 8
-
AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-11
medoid: 3300021509 12
-
AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-12
medoid: 3300029897 11
-
AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-13
medoid: pig GCA 946405745 1
-
AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-14
medoid: chicken MGYG000312581
-
AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-15
medoid: human MGYG000001479
-
AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-16
medoid: human MGYG000001610
-
AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-17
medoid: ruminant GCA 015058325 1
-
AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-18
medoid: human MGYG000002938
-
AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-19
medoid: pig BL unmapped bin 73
-
AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-20
medoid: pig QHF6 unmapped bin 566
-
AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-21
medoid: ruminant GCA 015056475 1
-
AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-22
medoid: ruminant GCA 015058375 1
-
AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-23
medoid: wastewater GEMS 3300001095 22
-
AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-24
medoid: wastewater GEMS 3300009769 43
-
AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-25
medoid: wastewater GEMS 3300025408 8
-
AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-26
medoid: wastewater GEMS 3300025618 31
-
AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1
medoid: human MGYG000000048
-
AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2
medoid: 3300014203 44
-
AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-1-1-3
medoid: 3300022227 62
-
AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-1-1-4
medoid: 3300026519 68
-
AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1
medoid: pig GCA 946405745 1
-
AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-1-2
medoid: 3300013131 77
-
AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-1-3
medoid: 3300017494 73
-
AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-1-1
medoid: pig GCA 946405745 1
-
AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-2
medoid: 3300012952 13
-
AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-3
medoid: 3300018018 17
-
AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-4
medoid: wastewater GEMS 3300000558 32
-
AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1-1
medoid: pig GCA 946405745 1
-
AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-2
medoid: 3300000234 54
-
AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-3
medoid: 3300009084 136
-
AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-4
medoid: 3300024433 41
-
AAI clade 11-1-1-1-1-1-1-1
medoid: pig GCA 946405745 1
-
AAI clade 11-1-1-1-1-1-2
medoid: wastewater ye ASMAG630
-
AAI clade 11-1-1-1-1-1-1
medoid: pig GCA 946405745 1
-
AAI clade 11-1-1-1-1-2
medoid: 3300013138 179
-
AAI clade 11-1-1-1-1-3
medoid: 3300021488 7
-
AAI clade 11-1-1-1-1-4
medoid: 3300027897 120
-
AAI clade 11-1-1-1-1-5
medoid: wastewater singleton GCA 016699795 1 ASM1669979v1 genomic
-
AAI clade 11-1-1-1-1-1
medoid: pig GCA 946405745 1
-
AAI clade 11-1-1-1-2
medoid: human MGYG000002377
-
AAI clade 11-1-1-1-3
medoid: pig BL unmapped bin 291
-
AAI clade 11-1-1-1-4
medoid: 3300000227 21
-
AAI clade 11-1-1-1-5
medoid: wastewater ye ASMAG1121
-
AAI clade 11-1-1-1-6
medoid: 3300021376 78
-
AAI clade 11-1-1-1-7
medoid: 3300027896 132
-
AAI clade 11-1-1-1-8
medoid: chicken GCA 019120235 1
-
AAI clade 11-1-1-1-9
medoid: chicken MGYG000308692
-
AAI clade 11-1-1-1-10
medoid: human MGYG000000115
-
AAI clade 11-1-1-1-11
medoid: ruminant GCA 015068615 1
-
AAI clade 11-1-1-1-12
medoid: wastewater GEMS 3300025748 62
-
AAI clade 11-1-1-1-13
medoid: wastewater ye ASMAG205
-
AAI clade 11-1-1-1-1
medoid: pig GCA 946405745 1
-
AAI clade 11-1-1-2
medoid: wastewater GEMS 3300028570 31
-
AAI clade 11-1-1-3
medoid: wastewater ye ASMAG1884
-
AAI clade 11-1-1-4
medoid: human MGYG000001276
-
AAI clade 11-1-1-5
medoid: wastewater GEMS 3300028622 26
-
AAI clade 11-1-1-6
medoid: wastewater GEMS 3300001095 19
-
AAI clade 11-1-1-7
medoid: wastewater GEMS 3300025855 140
-
AAI clade 11-1-1-8
medoid: 3300027896 119
-
AAI clade 11-1-1-9
medoid: human MGYG000003801
-
AAI clade 11-1-1-10
medoid: wastewater ye ASMAG1304
-
AAI clade 11-1-1-1
medoid: pig GCA 946405745 1
-
AAI clade 11-1-2
medoid: cow GCA 026651005 1
-
AAI clade 11-1-3
medoid: human MGYG000001309
-
AAI clade 11-1-4
medoid: human MGYG000003550
-
AAI clade 11-1-5
medoid: wastewater ye ASMAG368
-
AAI clade 11-1-1
medoid: pig GCA 946405745 1
-
AAI clade 11-2
medoid: human MGYG000002486
-
AAI clade 11-3
medoid: human MGYG000003114
-
AAI clade 11-4
medoid: pig MGYG000302445
-
AAI clade 11-5
medoid: dog SAMEA103957793 metabat2 high PE 001
-
AAI clade 11-6
medoid: chicken MHCFR05601 metabat2 low PE 003
-
AAI clade 11-7
medoid: pig QHF6 unmapped bin 170
-
AAI clade 11-8
medoid: chicken DSLFR04102 metabat2 low PE 033
-
AAI clade 11-9
medoid: pig LW1 s150971 bin 26
-
AAI clade 11-10
medoid: chicken MGYG000315728
-
AAI clade 11-11
medoid: human MGYG000002887
-
AAI clade 11-12
medoid: pig F5110 bin 54
-
AAI clade 11-13
medoid: human MGYG000001535
-
AAI clade 11-14
medoid: 3300024353 70
-
AAI clade 11-15
medoid: human MGYG000003150
-
AAI clade 11-16
medoid: 3300013132 34
-
AAI clade 11-17
medoid: human MGYG000002821
-
AAI clade 11-18
medoid: human MGYG000002901
-
AAI clade 11-19
medoid: human MGYG000001350
-
AAI clade 11-1
medoid: pig GCA 946405745 1
-
AAI clade 12
medoid: 3300006192 20
-
AAI clade 13
medoid: pig LW1 s150947 bin 23
-
AAI clade 14
medoid: dog Snoopy p1 metabat2 high PE 009
-
AAI clade 15
medoid: pig MGYG000302081
-
AAI clade 16
medoid: human MGYG000000545
-
AAI clade 17
medoid: human MGYG000003895
-
AAI clade 18
medoid: chicken MGYG000313561
-
AAI clade 19
medoid: 3300024912 1
-
AAI clade 20
medoid: human MGYG000002619
-
AAI clade 21
medoid: human MGYG000002428
-
AAI clade 22
medoid: 3300027805 13
-
AAI clade 23
medoid: chicken MGYG000314833
-
AAI clade 24
medoid: wastewater GEMS 3300027794 31
-
AAI clade 25
medoid: human MGYG000004406
-
AAI clade 26
medoid: pig MGYG000301788
-
AAI clade 27
medoid: 3300027834 52
-
AAI clade 28
medoid: 3300020389 13
-
AAI clade 29
medoid: 3300027835 270
-
AAI clade 30
medoid: 3300013004 97
-
AAI clade 31
medoid: 3300025065 6
-
AAI clade 32
medoid: human MGYG000004800
-
AAI clade 33
medoid: ruminant GCA 015060255 1
-
AAI clade 34
medoid: chicken GCA 019115885 1
-
AAI clade 35
medoid: pig SAMEA3663026 metabat2 high PE 017
-
AAI clade 36
medoid: human MGYG000000998
-
AAI clade 37
medoid: 3300012919 27
-
AAI clade 38
medoid: 3300027851 42
-
AAI clade 39
medoid: wastewater ye ASMAG566