AAI-based medoid clustering
The AAI clusters provide a good overview of the above-species structure of the datasets and facilitate taxonomic classification.
-
AAI clade 1
medoid: human MGYG000000946
-
AAI clade 2
medoid: human MGYG000000019
-
AAI clade 3
medoid: human MGYG000003370
-
AAI clade 4
medoid: 3300027323 37
-
AAI clade 5
medoid: human MGYG000004185
-
AAI clade 6
medoid: human MGYG000001010
-
AAI clade 7
medoid: wastewater GEMS 3300025861 51
-
AAI clade 8
medoid: human MGYG000002603
-
AAI clade 9
medoid: 3300024953 8
-
AAI clade 10
medoid: 3300017423 5
-
AAI clade 11
medoid: pig GCA 946405745 1
-
AAI clade 12
medoid: 3300006192 20
-
AAI clade 13
medoid: pig LW1 s150947 bin 23
-
AAI clade 14
medoid: dog Snoopy p1 metabat2 high PE 009
-
AAI clade 15
medoid: pig MGYG000302081
-
AAI clade 16
medoid: human MGYG000000545
-
AAI clade 17
medoid: human MGYG000003895
-
AAI clade 18
medoid: chicken MGYG000313561
-
AAI clade 19
medoid: 3300024912 1
-
AAI clade 20
medoid: human MGYG000002619
-
AAI clade 21
medoid: human MGYG000002428
-
AAI clade 22
medoid: 3300027805 13
-
AAI clade 23
medoid: chicken MGYG000314833
-
AAI clade 24
medoid: wastewater GEMS 3300027794 31
-
AAI clade 25
medoid: human MGYG000004406
-
AAI clade 26
medoid: pig MGYG000301788
-
AAI clade 27
medoid: 3300027834 52
-
AAI clade 27-1
medoid: 3300027834 52
-
AAI clade 27-1-1
medoid: 3300027834 52
-
AAI clade 27-1-1-1
medoid: 3300027834 52
-
AAI clade 27-1-1-1-1
medoid: 3300027834 52
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1
medoid: 3300027834 52
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1
medoid: 3300027834 52
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1
medoid: 3300027834 52
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1
medoid: 3300027834 52
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1
medoid: 3300027834 52
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1
medoid: 3300027834 52
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1
medoid: 3300027834 52
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1
medoid: 3300017788 72
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2
medoid: 3300027834 52
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1
medoid: 3300027834 52
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-1
medoid: 3300027834 52
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1
medoid: 3300027834 52
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1
medoid: 3300027834 52
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1
medoid: 3300027834 52
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1
medoid: 3300027834 52
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1
medoid: 3300027834 52
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1
medoid: 3300027834 52
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1
medoid: 3300027834 52
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1
medoid: 3300003178 3
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2
medoid: 3300027834 52
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1
medoid: 3300027834 52
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-1
medoid: 3300027834 52
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-2
medoid: 3300025881 20
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-3
medoid: 3300025731 28
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-4
medoid: 3300025738 23
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-5
medoid: 3300025815 10
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-6
medoid: 3300027972 10
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-7
medoid: 3300028400 41
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-8
medoid: 3300028599 14
1 dataset: 3300028599 14 (AAI: 100.0%)
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-9
medoid: 3300029891 16
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-10
medoid: human MGYG000003119
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-11
medoid: wastewater GEMS 3300026516 56
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-1
medoid: 3300027834 52
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-2
medoid: 3300010055 9
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-3
medoid: 3300012000 28
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-4
medoid: 3300012936 12
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-5
medoid: 3300017532 20
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-6
medoid: 3300020426 2
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-7
medoid: 3300027704 30
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-8
medoid: 3300027571 6
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-9
medoid: 3300027973 17
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-10
medoid: 3300027983 44
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-11
medoid: wastewater ye ASMAG1320
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-12
medoid: wastewater ye ASMAG407
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-13
medoid: wastewater ye ASMAG46
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1
medoid: 3300027834 52
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1
medoid: 3300003178 3
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-2
medoid: 3300004097 59
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-3
medoid: 3300005858 13
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-4
medoid: 3300028400 27
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-5
medoid: wastewater GEMS 3300026516 27
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1
medoid: 3300027834 52
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-2
medoid: 3300025047 2
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-3
medoid: 3300025816 18
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1
medoid: 3300027834 52
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-2
medoid: 3300009703 46
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1
medoid: 3300027834 52
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-2
medoid: 3300014203 21
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-3
medoid: 3300015360 78
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-4
medoid: 3300020213 15
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-5
medoid: 3300020405 7
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-6
medoid: 3300027839 100
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1
medoid: 3300027834 52
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-2
medoid: 3300022227 18
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-3
medoid: 3300027742 34
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-4
medoid: 3300027878 64
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-5
medoid: 3300027980 24
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1
medoid: 3300027834 52
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-2
medoid: wastewater ye ASMAG1988
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-3
medoid: wastewater ye ASMAG2036
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1
medoid: 3300027834 52
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-1-2
medoid: wastewater GEMS 3300009779 112
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1
medoid: 3300027834 52
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-2
medoid: wastewater GEMS 3300025706 23
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1-1
medoid: 3300027834 52
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-2
medoid: 3300013138 217
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1
medoid: 3300027834 52
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-3
medoid: 3300003894 16
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-4
medoid: 3300027649 9
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-5
medoid: 3300021484 9
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-6
medoid: 3300025266 2
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-7
medoid: wastewater ye ASMAG1977
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1
medoid: 3300017788 72
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2
medoid: 3300013132 118
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1
medoid: 3300027834 52
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2
medoid: 3300025637 21
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-3
medoid: 3300027656 8
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1
medoid: 3300027834 52
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-2
medoid: 3300025639 21
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-3
medoid: 3300023273 28
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-4
medoid: 3300025869 61
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-5
medoid: 3300028569 43
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1-1
medoid: 3300027834 52
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-2
medoid: chicken MGYG000316702
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1-1
medoid: 3300027834 52
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-2
medoid: 3300020477 126
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1-1
medoid: 3300027834 52
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-2
medoid: 3300010368 5
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-3
medoid: 3300009083 165
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-4
medoid: 3300023179 70
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1-1
medoid: 3300027834 52
-
AAI clade 27-1-1-1-1-2
medoid: 3300025570 12
-
AAI clade 27-1-1-1-1-3
medoid: 3300025809 51
-
AAI clade 27-1-1-1-1-1
medoid: 3300027834 52
-
AAI clade 27-1-1-1-2
medoid: 3300020474 30
-
AAI clade 27-1-1-1-3
medoid: 3300027983 81
-
AAI clade 27-1-1-1-4
medoid: wastewater GEMS 3300009704 44
-
AAI clade 27-1-1-1-1
medoid: 3300027834 52
-
AAI clade 27-1-1-2
medoid: wastewater GEMS 3300026302 24
-
AAI clade 27-1-1-1
medoid: 3300027834 52
-
AAI clade 27-1-2
medoid: wastewater GEMS 3300012020 5
-
AAI clade 27-1-3
medoid: 3300027687 28
-
AAI clade 27-1-4
medoid: 3300024313 10
-
AAI clade 27-1-5
medoid: 3300027834 57
-
AAI clade 27-1-6
medoid: wastewater singleton GCA 016721245 1 ASM1672124v1 genomic
-
AAI clade 27-1-7
medoid: wastewater ye ASMAG327
-
AAI clade 27-1-1
medoid: 3300027834 52
-
AAI clade 27-2
medoid: 3300020388 27
-
AAI clade 27-3
medoid: wastewater ye ASMAG1431
-
AAI clade 27-4
medoid: wastewater singleton GCA 016707115 1 ASM1670711v1 genomic
-
AAI clade 27-5
medoid: 3300027870 45
-
AAI clade 27-6
medoid: 3300013131 106
-
AAI clade 27-7
medoid: 3300027963 13
-
AAI clade 27-8
medoid: wastewater singleton GCA 016712535 1 ASM1671253v1 genomic
-
AAI clade 27-9
medoid: wastewater singleton GCA 016708845 1 ASM1670884v1 genomic
-
AAI clade 27-1
medoid: 3300027834 52
-
AAI clade 28
medoid: 3300020389 13
-
AAI clade 29
medoid: 3300027835 270
-
AAI clade 30
medoid: 3300013004 97
-
AAI clade 31
medoid: 3300025065 6
-
AAI clade 32
medoid: human MGYG000004800
-
AAI clade 33
medoid: ruminant GCA 015060255 1
-
AAI clade 34
medoid: chicken GCA 019115885 1
-
AAI clade 35
medoid: pig SAMEA3663026 metabat2 high PE 017
-
AAI clade 36
medoid: human MGYG000000998
-
AAI clade 37
medoid: 3300012919 27
-
AAI clade 38
medoid: 3300027851 42
-
AAI clade 39
medoid: wastewater ye ASMAG566