AAI clade 1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-3 | MiGA Online

skip navigation

AAI-based medoid clustering

The AAI clusters provide a good overview of the above-species structure of the datasets and facilitate taxonomic classification.

AAI clade 1 medoid: human MGYG000000946
- AAI clade 1-1 medoid: human MGYG000000946
  - AAI clade 1-1-1 medoid: human MGYG000000946
    
    AAI clade 1-1-1-1 medoid: human MGYG000000946
    
    AAI clade 1-1-1-1-1 medoid: human MGYG000000946
    
    AAI clade 1-1-1-1-1-1 medoid: human MGYG000000946
    
    AAI clade 1-1-1-1-1-1-1 medoid: human MGYG000000946
    
    AAI clade 1-1-1-1-1-1-1-1 medoid: human MGYG000000946
    
    AAI clade 1-1-1-1-1-1-1-1-1 medoid: human MGYG000002928
    
    AAI clade 1-1-1-1-1-1-1-1-1-1 medoid: human MGYG000002928
    
    AAI clade 1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1 medoid: human MGYG000002928
    
    AAI clade 1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1 medoid: human MGYG000002928
    
    AAI clade 1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1 medoid: human MGYG000003037
    
    AAI clade 1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2 medoid: human MGYG000004220
    
    AAI clade 1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-3 medoid: cat SAMEA3387478 metabat2 low PE 027
    
    1 dataset: cat SAMEA3387478 metabat2 low PE 027 (AAI: 100.0%)
    
    AAI clade 1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-4 medoid: human MGYG000002928
    
    AAI clade 1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-5 medoid: human MGYG000003266
    
    AAI clade 1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-6 medoid: human MGYG000003982
    
    AAI clade 1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-7 medoid: human MGYG000000094
    
    AAI clade 1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-8 medoid: human MGYG000000324
    
    AAI clade 1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-9 medoid: human MGYG000000770
    
    AAI clade 1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-10 medoid: human MGYG000001126
    
    AAI clade 1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-11 medoid: human MGYG000001653
    
    AAI clade 1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-12 medoid: human MGYG000002231
    
    AAI clade 1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-13 medoid: human MGYG000002733
    
    AAI clade 1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-14 medoid: human MGYG000002743
    
    AAI clade 1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-15 medoid: human MGYG000002853
    
    AAI clade 1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-16 medoid: human MGYG000002958
    
    AAI clade 1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-17 medoid: human MGYG000002971
    
    AAI clade 1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-18 medoid: human MGYG000003083
    
    AAI clade 1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-19 medoid: human MGYG000003174
    
    AAI clade 1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-20 medoid: human MGYG000003462
    
    AAI clade 1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-21 medoid: human MGYG000003885
    
    AAI clade 1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-22 medoid: human MGYG000003900
    
    AAI clade 1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-23 medoid: human MGYG000003928
    
    AAI clade 1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-24 medoid: human MGYG000004040
    
    AAI clade 1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-25 medoid: human MGYG000004227
    
    AAI clade 1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-26 medoid: human MGYG000004421
    
    AAI clade 1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-27 medoid: human MGYG000004765
    
    AAI clade 1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2 medoid: human MGYG000003823
    
    AAI clade 1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2 medoid: human MGYG000001009
    
    AAI clade 1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-3 medoid: human MGYG000003157
    
    AAI clade 1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-4 medoid: human MGYG000003168
    
    AAI clade 1-1-1-1-1-1-1-1-1-2 medoid: human MGYG000000947
    
    AAI clade 1-1-1-1-1-1-1-1-1-3 medoid: human MGYG000003027
    
    AAI clade 1-1-1-1-1-1-1-1-2 medoid: human MGYG000000946
    
    AAI clade 1-1-1-1-1-1-1-1-3 medoid: human MGYG000000955
    
    AAI clade 1-1-1-1-1-1-1-2 medoid: human MGYG000003020
    
    AAI clade 1-1-1-1-1-1-1-3 medoid: human MGYG000003159
    
    AAI clade 1-1-1-1-1-1-2 medoid: human MGYG000001108
    
    AAI clade 1-1-1-1-1-1-3 medoid: human MGYG000002112
    
    AAI clade 1-1-1-1-1-2 medoid: human MGYG000001025
    
    AAI clade 1-1-1-1-1-3 medoid: human MGYG000001236
    
    AAI clade 1-1-1-1-2 medoid: chicken MGYG000308266
    
    AAI clade 1-1-1-1-3 medoid: ruminant GCA 015062655 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-4 medoid: pig MGYG000299739
    
    AAI clade 1-1-1-1-5 medoid: wastewater GEMS 3300025714 31
    
    AAI clade 1-1-1-1-6 medoid: wastewater ye ASMAG1312
    
    AAI clade 1-1-1-2 medoid: 3300022916 36
  - AAI clade 1-1-2 medoid: human MGYG000001605
  - AAI clade 1-1-3 medoid: 3300002053 69
  - AAI clade 1-1-4 medoid: 3300013137 156
  - AAI clade 1-1-5 medoid: human MGYG000000585
- AAI clade 1-2 medoid: human MGYG000003624
- AAI clade 1-3 medoid: human MGYG000000907
- AAI clade 1-4 medoid: human MGYG000000643
- AAI clade 1-5 medoid: human MGYG000002074
- AAI clade 1-6 medoid: 3300023176 42
- AAI clade 1-7 medoid: human MGYG000001154
AAI clade 2 medoid: human MGYG000000019
AAI clade 3 medoid: human MGYG000003370
AAI clade 4 medoid: 3300027323 37
AAI clade 5 medoid: human MGYG000004185
AAI clade 6 medoid: human MGYG000001010
AAI clade 7 medoid: wastewater GEMS 3300025861 51
AAI clade 8 medoid: human MGYG000002603
AAI clade 9 medoid: 3300024953 8
AAI clade 10 medoid: 3300017423 5
AAI clade 11 medoid: pig GCA 946405745 1
AAI clade 12 medoid: 3300006192 20
AAI clade 13 medoid: pig LW1 s150947 bin 23
AAI clade 14 medoid: dog Snoopy p1 metabat2 high PE 009
AAI clade 15 medoid: pig MGYG000302081
AAI clade 16 medoid: human MGYG000000545
AAI clade 17 medoid: human MGYG000003895
AAI clade 18 medoid: chicken MGYG000313561
AAI clade 19 medoid: 3300024912 1
AAI clade 20 medoid: human MGYG000002619
AAI clade 21 medoid: human MGYG000002428
AAI clade 22 medoid: 3300027805 13
AAI clade 23 medoid: chicken MGYG000314833
AAI clade 24 medoid: wastewater GEMS 3300027794 31
AAI clade 25 medoid: human MGYG000004406
AAI clade 26 medoid: pig MGYG000301788
AAI clade 27 medoid: 3300027834 52
AAI clade 28 medoid: 3300020389 13
AAI clade 29 medoid: 3300027835 270
AAI clade 30 medoid: 3300013004 97
AAI clade 31 medoid: 3300025065 6
AAI clade 32 medoid: human MGYG000004800
AAI clade 33 medoid: ruminant GCA 015060255 1
AAI clade 34 medoid: chicken GCA 019115885 1
AAI clade 35 medoid: pig SAMEA3663026 metabat2 high PE 017
AAI clade 36 medoid: human MGYG000000998
AAI clade 37 medoid: 3300012919 27
AAI clade 38 medoid: 3300027851 42
AAI clade 39 medoid: wastewater ye ASMAG566

A collaboration between