AAI-based medoid clustering
The AAI clusters provide a good overview of the above-species structure of the datasets and facilitate taxonomic classification.
-
AAI clade 1
medoid: GCA 017502845 1
-
AAI clade 2
medoid: GCA 002434265 1
-
AAI clade 3
medoid: GCA 013002175 1
-
AAI clade 4
medoid: GCA 900110395 1
-
AAI clade 5
medoid: GCA 012798955 1
-
AAI clade 6
medoid: GCA 013415575 1
-
AAI clade 7
medoid: GCF 008638345 1
-
AAI clade 8
medoid: GCF 000807255 1
-
AAI clade 9
medoid: GCF 001050135 1
-
AAI clade 10
medoid: GCA 002717245 1
-
AAI clade 10-1
medoid: GCA 902595625 1
-
AAI clade 10-1-1
medoid: GCA 902595625 1
-
AAI clade 10-1-1-1
medoid: GCA 902595625 1
-
AAI clade 10-1-1-1-1
medoid: GCA 902595625 1
-
AAI clade 10-1-1-1-1-1
medoid: GCA 902595625 1
-
AAI clade 10-1-1-1-1-1-1
medoid: GCA 902595625 1
-
AAI clade 10-1-1-1-1-1-1-1
medoid: GCA 001321855 1
-
AAI clade 10-1-1-1-1-1-1-2
medoid: GCA 902595625 1
-
AAI clade 10-1-1-1-1-1-1-2-1
medoid: GCA 002170875 2
-
AAI clade 10-1-1-1-1-1-1-2-2
medoid: GCA 002171035 2
-
AAI clade 10-1-1-1-1-1-1-2-3
medoid: GCA 002457475 1
-
AAI clade 10-1-1-1-1-1-1-2-4
medoid: GCA 003284275 1
-
AAI clade 10-1-1-1-1-1-1-2-5
medoid: GCA 014653835 1
-
AAI clade 10-1-1-1-1-1-1-2-6
medoid: GCA 902537845 1
-
AAI clade 10-1-1-1-1-1-1-2-7
medoid: GCA 902554785 1
-
AAI clade 10-1-1-1-1-1-1-2-8
medoid: GCA 902573985 1
-
AAI clade 10-1-1-1-1-1-1-2-9
medoid: GCA 902595625 1
-
AAI clade 10-1-1-1-1-1-1-2-9-1
medoid: GCA 902595625 1
8 datasets: GCA 902575095 1 (AAI: 76.05%), GCA 902590465 1 (AAI: 77.26%), GCA 902590625 1 (AAI: 76.96%), GCA 902595625 1 (AAI: 100.0%), GCA 902601705 1 (AAI: 76.79%), GCA 902615715 1 (AAI: 76.17%), GCA 902630925 1 (AAI: 79.82%), and GCA 902631535 1 (AAI: 76.18%)
-
AAI clade 10-1-1-1-1-1-1-2-9-2
medoid: GCA 902590285 1
-
AAI clade 10-1-1-1-1-1-1-2-9-3
medoid: GCA 902609855 1
-
AAI clade 10-1-1-1-1-1-1-2-9-1
medoid: GCA 902595625 1
-
AAI clade 10-1-1-1-1-1-1-2-10
medoid: GCA 902584365 1
-
AAI clade 10-1-1-1-1-1-1-2-11
medoid: GCA 902590755 1
-
AAI clade 10-1-1-1-1-1-1-2-12
medoid: GCA 902591415 1
-
AAI clade 10-1-1-1-1-1-1-2-13
medoid: GCA 902595375 1
-
AAI clade 10-1-1-1-1-1-1-2-14
medoid: GCA 902596205 1
-
AAI clade 10-1-1-1-1-1-1-2-15
medoid: GCA 902598735 1
-
AAI clade 10-1-1-1-1-1-1-2-16
medoid: GCA 902604695 1
-
AAI clade 10-1-1-1-1-1-1-2-17
medoid: GCA 902626045 1
-
AAI clade 10-1-1-1-1-1-1-2-18
medoid: GCA 902632145 1
-
AAI clade 10-1-1-1-1-1-1-2-1
medoid: GCA 002170875 2
-
AAI clade 10-1-1-1-1-1-1-1
medoid: GCA 001321855 1
-
AAI clade 10-1-1-1-1-1-2
medoid: GCA 002692325 1
-
AAI clade 10-1-1-1-1-1-3
medoid: GCA 902594835 1
-
AAI clade 10-1-1-1-1-1-1
medoid: GCA 902595625 1
-
AAI clade 10-1-1-1-1-2
medoid: GCA 902561585 1
-
AAI clade 10-1-1-1-1-3
medoid: GCA 001730065 1
-
AAI clade 10-1-1-1-1-4
medoid: GCA 902567145 1
-
AAI clade 10-1-1-1-1-5
medoid: GCF 007993655 1
-
AAI clade 10-1-1-1-1-1
medoid: GCA 902595625 1
-
AAI clade 10-1-1-1-2
medoid: GCA 902589155 1
-
AAI clade 10-1-1-1-3
medoid: GCA 902606665 1
-
AAI clade 10-1-1-1-4
medoid: GCA 003212055 1
-
AAI clade 10-1-1-1-5
medoid: GCA 905620505 1
-
AAI clade 10-1-1-1-1
medoid: GCA 902595625 1
-
AAI clade 10-1-1-2
medoid: GCA 008638225 1
-
AAI clade 10-1-1-3
medoid: GCF 000829315 1
-
AAI clade 10-1-1-1
medoid: GCA 902595625 1
-
AAI clade 10-1-2
medoid: GCA 902572475 1
-
AAI clade 10-1-3
medoid: GCA 902561155 1
-
AAI clade 10-1-1
medoid: GCA 902595625 1
-
AAI clade 10-2
medoid: GCA 902602135 1
-
AAI clade 10-3
medoid: GCA 902597515 1
-
AAI clade 10-4
medoid: GCA 902568425 1
-
AAI clade 10-5
medoid: GCA 902624345 1
-
AAI clade 10-6
medoid: GCA 902589395 1
-
AAI clade 10-7
medoid: GCA 902541515 1
-
AAI clade 10-8
medoid: GCA 902535625 1
-
AAI clade 10-9
medoid: GCA 902533965 1
-
AAI clade 10-10
medoid: GCA 902604225 1
-
AAI clade 10-11
medoid: GCA 902599045 1
-
AAI clade 10-12
medoid: GCA 902622795 1
-
AAI clade 10-13
medoid: GCA 902546375 1
-
AAI clade 10-1
medoid: GCA 902595625 1
-
AAI clade 11
medoid: GCA 017478625 1
-
AAI clade 12
medoid: GCA 009773355 1
-
AAI clade 13
medoid: GCA 905200435 1
-
AAI clade 14
medoid: GCA 017516885 1
-
AAI clade 15
medoid: GCA 004321885 1
-
AAI clade 16
medoid: GCA 905236305 1
-
AAI clade 17
medoid: GCA 017648525 1
-
AAI clade 18
medoid: GCA 019113065 1
-
AAI clade 19
medoid: GCA 016795075 1
-
AAI clade 20
medoid: GCF 001467025 1
-
AAI clade 21
medoid: GCA 017642855 1
-
AAI clade 22
medoid: GCA 017408305 1
-
AAI clade 23
medoid: GCA 002436405 1