AAI-based medoid clustering

The AAI clusters provide a good overview of the above-species structure of the datasets and facilitate taxonomic classification.

  • AAI clade 1 medoid: GCA 017502845 1
  • AAI clade 2 medoid: GCA 002434265 1
  • AAI clade 3 medoid: GCA 013002175 1
  • AAI clade 4 medoid: GCA 900110395 1
  • AAI clade 5 medoid: GCA 012798955 1
  • AAI clade 6 medoid: GCA 013415575 1
  • AAI clade 7 medoid: GCF 008638345 1
  • AAI clade 8 medoid: GCF 000807255 1
  • AAI clade 9 medoid: GCF 001050135 1
  • AAI clade 10 medoid: GCA 002717245 1
    • AAI clade 10-1 medoid: GCA 902595625 1
      • AAI clade 10-1-1 medoid: GCA 902595625 1
        • AAI clade 10-1-1-1 medoid: GCA 902595625 1
          • AAI clade 10-1-1-1-1 medoid: GCA 902595625 1
            • AAI clade 10-1-1-1-1-1 medoid: GCA 902595625 1
              • AAI clade 10-1-1-1-1-1-1 medoid: GCA 902595625 1
                • AAI clade 10-1-1-1-1-1-1-1 medoid: GCA 001321855 1
                • AAI clade 10-1-1-1-1-1-1-2 medoid: GCA 902595625 1
                  • AAI clade 10-1-1-1-1-1-1-2-1 medoid: GCA 002170875 2
                  • AAI clade 10-1-1-1-1-1-1-2-2 medoid: GCA 002171035 2
                  • AAI clade 10-1-1-1-1-1-1-2-3 medoid: GCA 002457475 1
                  • AAI clade 10-1-1-1-1-1-1-2-4 medoid: GCA 003284275 1
                  • AAI clade 10-1-1-1-1-1-1-2-5 medoid: GCA 014653835 1
                  • AAI clade 10-1-1-1-1-1-1-2-6 medoid: GCA 902537845 1
                  • AAI clade 10-1-1-1-1-1-1-2-7 medoid: GCA 902554785 1
                  • AAI clade 10-1-1-1-1-1-1-2-8 medoid: GCA 902573985 1
                  • AAI clade 10-1-1-1-1-1-1-2-9 medoid: GCA 902595625 1
                  • AAI clade 10-1-1-1-1-1-1-2-10 medoid: GCA 902584365 1
                  • AAI clade 10-1-1-1-1-1-1-2-11 medoid: GCA 902590755 1
                  • AAI clade 10-1-1-1-1-1-1-2-12 medoid: GCA 902591415 1
                    1 dataset: GCA 902591415 1 (AAI: 100.0%)
                  • AAI clade 10-1-1-1-1-1-1-2-13 medoid: GCA 902595375 1
                  • AAI clade 10-1-1-1-1-1-1-2-14 medoid: GCA 902596205 1
                  • AAI clade 10-1-1-1-1-1-1-2-15 medoid: GCA 902598735 1
                  • AAI clade 10-1-1-1-1-1-1-2-16 medoid: GCA 902604695 1
                  • AAI clade 10-1-1-1-1-1-1-2-17 medoid: GCA 902626045 1
                  • AAI clade 10-1-1-1-1-1-1-2-18 medoid: GCA 902632145 1
              • AAI clade 10-1-1-1-1-1-2 medoid: GCA 002692325 1
              • AAI clade 10-1-1-1-1-1-3 medoid: GCA 902594835 1
            • AAI clade 10-1-1-1-1-2 medoid: GCA 902561585 1
            • AAI clade 10-1-1-1-1-3 medoid: GCA 001730065 1
            • AAI clade 10-1-1-1-1-4 medoid: GCA 902567145 1
            • AAI clade 10-1-1-1-1-5 medoid: GCF 007993655 1
          • AAI clade 10-1-1-1-2 medoid: GCA 902589155 1
          • AAI clade 10-1-1-1-3 medoid: GCA 902606665 1
          • AAI clade 10-1-1-1-4 medoid: GCA 003212055 1
          • AAI clade 10-1-1-1-5 medoid: GCA 905620505 1
        • AAI clade 10-1-1-2 medoid: GCA 008638225 1
        • AAI clade 10-1-1-3 medoid: GCF 000829315 1
      • AAI clade 10-1-2 medoid: GCA 902572475 1
      • AAI clade 10-1-3 medoid: GCA 902561155 1
    • AAI clade 10-2 medoid: GCA 902602135 1
    • AAI clade 10-3 medoid: GCA 902597515 1
    • AAI clade 10-4 medoid: GCA 902568425 1
    • AAI clade 10-5 medoid: GCA 902624345 1
    • AAI clade 10-6 medoid: GCA 902589395 1
    • AAI clade 10-7 medoid: GCA 902541515 1
    • AAI clade 10-8 medoid: GCA 902535625 1
    • AAI clade 10-9 medoid: GCA 902533965 1
    • AAI clade 10-10 medoid: GCA 902604225 1
    • AAI clade 10-11 medoid: GCA 902599045 1
    • AAI clade 10-12 medoid: GCA 902622795 1
    • AAI clade 10-13 medoid: GCA 902546375 1
  • AAI clade 11 medoid: GCA 017478625 1
  • AAI clade 12 medoid: GCA 009773355 1
  • AAI clade 13 medoid: GCA 905200435 1
  • AAI clade 14 medoid: GCA 017516885 1
  • AAI clade 15 medoid: GCA 004321885 1
  • AAI clade 16 medoid: GCA 905236305 1
  • AAI clade 17 medoid: GCA 017648525 1
  • AAI clade 18 medoid: GCA 019113065 1
  • AAI clade 19 medoid: GCA 016795075 1
  • AAI clade 20 medoid: GCF 001467025 1
  • AAI clade 21 medoid: GCA 017642855 1
  • AAI clade 22 medoid: GCA 017408305 1
  • AAI clade 23 medoid: GCA 002436405 1