AAI-based medoid clustering
The AAI clusters provide a good overview of the above-species structure of the datasets and facilitate taxonomic classification.
-
AAI clade 1
medoid: GCA 017502845 1
-
AAI clade 1-1
medoid: GCA 900546775 1
-
AAI clade 1-2
medoid: GCA 905221215 1
-
AAI clade 1-3
medoid: GCF 015326965 1
-
AAI clade 1-4
medoid: GCF 900094905 1
-
AAI clade 1-5
medoid: GCF 008764295 1
-
AAI clade 1-6
medoid: GCA 900551895 1
-
AAI clade 1-7
medoid: GCF 009193305 1
-
AAI clade 1-8
medoid: GCA 017503135 1
-
AAI clade 1-9
medoid: GCA 900552565 1
-
AAI clade 1-10
medoid: GCA 017411305 1
-
AAI clade 1-11
medoid: GCF 001465345 1
-
AAI clade 1-12
medoid: GCA 900759455 1
-
AAI clade 1-13
medoid: GCF 015207245 1
-
AAI clade 1-14
medoid: GCA 017960805 1
-
AAI clade 1-15
medoid: GCA 001604115 1
-
AAI clade 1-16
medoid: GCA 900551775 1
-
AAI clade 1-17
medoid: GCA 016929555 1
-
AAI clade 1-18
medoid: GCF 004770145 1
-
AAI clade 1-19
medoid: GCF 004745505 1
-
AAI clade 1-20
medoid: GCA 900761225 1
-
AAI clade 1-21
medoid: GCA 900556695 1
-
AAI clade 1-21-1
medoid: GCA 900556695 1
-
AAI clade 1-21-1-1
medoid: GCA 900556695 1
-
AAI clade 1-21-1-1-1
medoid: GCA 900556695 1
-
AAI clade 1-21-1-1-1-1
medoid: GCA 900556695 1
-
AAI clade 1-21-1-1-1-1-1
medoid: GCA 000431335 1
-
AAI clade 1-21-1-1-1-1-2
medoid: GCA 000434035 1
-
AAI clade 1-21-1-1-1-1-3
medoid: GCA 900552555 1
8 datasets: GCA 000435535 1 (AAI: 69.06%), GCA 000438255 1 (AAI: 80.83%), GCA 001916005 1 (AAI: 70.09%), GCA 001916065 1 (AAI: 85.1%), GCA 017410505 1 (AAI: 71.48%), GCA 900551615 1 (AAI: 79.04%), GCA 900552555 1 (AAI: 100.0%), and GCA 900753165 1 (AAI: 86.67%)
-
AAI clade 1-21-1-1-1-1-4
medoid: GCA 017613275 1
-
AAI clade 1-21-1-1-1-1-5
medoid: GCA 001303765 1
-
AAI clade 1-21-1-1-1-1-6
medoid: GCA 002441125 1
-
AAI clade 1-21-1-1-1-1-7
medoid: GCA 001771545 1
-
AAI clade 1-21-1-1-1-1-8
medoid: GCA 001872925 1
-
AAI clade 1-21-1-1-1-1-9
medoid: GCA 001872945 1
-
AAI clade 1-21-1-1-1-1-10
medoid: GCA 003525075 1
-
AAI clade 1-21-1-1-1-1-11
medoid: GCA 900754285 1
-
AAI clade 1-21-1-1-1-1-12
medoid: GCA 002176905 1
-
AAI clade 1-21-1-1-1-1-13
medoid: GCA 002305115 1
-
AAI clade 1-21-1-1-1-1-14
medoid: GCA 900556345 1
-
AAI clade 1-21-1-1-1-1-15
medoid: GCA 017510825 1
-
AAI clade 1-21-1-1-1-1-16
medoid: GCA 017456555 1
-
AAI clade 1-21-1-1-1-1-17
medoid: GCA 002688185 1
-
AAI clade 1-21-1-1-1-1-18
medoid: GCA 002714425 1
-
AAI clade 1-21-1-1-1-1-19
medoid: GCA 002721445 1
-
AAI clade 1-21-1-1-1-1-20
medoid: GCA 015489055 1
-
AAI clade 1-21-1-1-1-1-21
medoid: GCA 016218625 1
-
AAI clade 1-21-1-1-1-1-22
medoid: GCA 002898315 1
-
AAI clade 1-21-1-1-1-1-23
medoid: GCA 003246505 1
-
AAI clade 1-21-1-1-1-1-24
medoid: GCA 003518755 1
-
AAI clade 1-21-1-1-1-1-25
medoid: GCA 003648245 1
-
AAI clade 1-21-1-1-1-1-26
medoid: GCA 900555075 1
-
AAI clade 1-21-1-1-1-1-27
medoid: GCA 900555835 1
-
AAI clade 1-21-1-1-1-1-28
medoid: GCA 011390075 1
-
AAI clade 1-21-1-1-1-1-29
medoid: GCA 012517765 1
-
AAI clade 1-21-1-1-1-1-30
medoid: GCA 013287265 1
-
AAI clade 1-21-1-1-1-1-31
medoid: GCA 900553945 1
-
AAI clade 1-21-1-1-1-1-32
medoid: GCA 015056485 1
-
AAI clade 1-21-1-1-1-1-33
medoid: GCA 018818755 1
-
AAI clade 1-21-1-1-1-1-34
medoid: GCA 016935395 1
-
AAI clade 1-21-1-1-1-1-35
medoid: GCA 905215845 1
-
AAI clade 1-21-1-1-1-1-36
medoid: GCA 017465925 1
-
AAI clade 1-21-1-1-1-1-37
medoid: GCA 900759475 1
-
AAI clade 1-21-1-1-1-1-38
medoid: GCA 905198755 1
-
AAI clade 1-21-1-1-1-1-39
medoid: GCA 017651625 1
-
AAI clade 1-21-1-1-1-1-40
medoid: GCA 017860675 1
-
AAI clade 1-21-1-1-1-1-41
medoid: GCA 018825365 1
-
AAI clade 1-21-1-1-1-1-42
medoid: GCA 018829865 1
-
AAI clade 1-21-1-1-1-1-43
medoid: GCA 018903255 1
-
AAI clade 1-21-1-1-1-1-44
medoid: GCF 000245755 1
-
AAI clade 1-21-1-1-1-1-45
medoid: GCA 905200315 1
-
AAI clade 1-21-1-1-1-1-46
medoid: GCF 000021565 1
-
AAI clade 1-21-1-1-1-1-1
medoid: GCA 000431335 1
-
AAI clade 1-21-1-1-1-2
medoid: GCA 900317935 1
-
AAI clade 1-21-1-1-1-1
medoid: GCA 900556695 1
-
AAI clade 1-21-1-1-2
medoid: GCA 905215935 1
-
AAI clade 1-21-1-1-3
medoid: GCA 016183265 1
-
AAI clade 1-21-1-1-1
medoid: GCA 900556695 1
-
AAI clade 1-21-1-2
medoid: GCA 900553015 1
-
AAI clade 1-21-1-1
medoid: GCA 900556695 1
-
AAI clade 1-21-2
medoid: GCA 002404755 1
-
AAI clade 1-21-1
medoid: GCA 900556695 1
-
AAI clade 1-22
medoid: GCA 017504995 1
-
AAI clade 1-23
medoid: GCA 900550055 1
-
AAI clade 1-24
medoid: GCA 017464135 1
-
AAI clade 1-25
medoid: GCA 014860805 1
-
AAI clade 1-1
medoid: GCA 900546775 1
-
AAI clade 2
medoid: GCA 002434265 1
-
AAI clade 3
medoid: GCA 013002175 1
-
AAI clade 4
medoid: GCA 900110395 1
-
AAI clade 5
medoid: GCA 012798955 1
-
AAI clade 6
medoid: GCA 013415575 1
-
AAI clade 7
medoid: GCF 008638345 1
-
AAI clade 8
medoid: GCF 000807255 1
-
AAI clade 9
medoid: GCF 001050135 1
-
AAI clade 10
medoid: GCA 002717245 1
-
AAI clade 11
medoid: GCA 017478625 1
-
AAI clade 12
medoid: GCA 009773355 1
-
AAI clade 13
medoid: GCA 905200435 1
-
AAI clade 14
medoid: GCA 017516885 1
-
AAI clade 15
medoid: GCA 004321885 1
-
AAI clade 16
medoid: GCA 905236305 1
-
AAI clade 17
medoid: GCA 017648525 1
-
AAI clade 18
medoid: GCA 019113065 1
-
AAI clade 19
medoid: GCA 016795075 1
-
AAI clade 20
medoid: GCF 001467025 1
-
AAI clade 21
medoid: GCA 017642855 1
-
AAI clade 22
medoid: GCA 017408305 1
-
AAI clade 23
medoid: GCA 002436405 1