AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-18 | MiGA Online

skip navigation

AAI-based medoid clustering

The AAI clusters provide a good overview of the above-species structure of the datasets and facilitate taxonomic classification.

AAI clade 1 medoid: Brucella daejeonensis GCA 014199265 1
AAI clade 2 medoid: GCA 017448355 1
AAI clade 3 medoid: GCA 017467885 1
AAI clade 4 medoid: Pedobacter duraquae GCA 004362245 1
AAI clade 5 medoid: Streptomyces angustmyceticus GCA 002154415 1
AAI clade 6 medoid: Pseudomonas migulae GCA 024169545 1
AAI clade 7 medoid: miga SS18A Bin 41 contigs
AAI clade 8 medoid: Mucilaginibacter ginkgonis GCA 009754905 2
AAI clade 9 medoid: GCA 900755995 1
AAI clade 10 medoid: GCF 013113835 1
AAI clade 11 medoid: Secundilactobacillus odoratitofui DSM 19909 JCM 15043 GCA 001434895 1
AAI clade 12 medoid: GCA 016840965 1
AAI clade 13 medoid: GCA 017622235 1
AAI clade 14 medoid: GCA 904390925 1
AAI clade 15 medoid: GCA 002375985 1
AAI clade 16 medoid: GCA 003963015 1
AAI clade 17 medoid: GCA 001771585 1
AAI clade 18 medoid: GCF 018398895 1
AAI clade 19 medoid: GCA 001295775 1
AAI clade 20 medoid: Qipengyuania aquimaris GCA 009827445 1
AAI clade 21 medoid: GCF 009363535 1
- AAI clade 21-1 medoid: miga ZQ19A BG 605
  - AAI clade 21-1-1 medoid: Solimonas flava DSM 18980 GCA 000426685 1
  - AAI clade 21-1-2 medoid: miga ZQ19A BG 605
    
    AAI clade 21-1-2-1 medoid: miga ZQ19A BG 605
    
    AAI clade 21-1-2-1-1 medoid: miga ZQ19A BG 605
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1 medoid: miga ZQ19A BG 605
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1 medoid: miga ZQ19A BG 605
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1 medoid: miga ZQ19A BG 605
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1 medoid: miga ZQ19A BG 605
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1 medoid: miga ZQ19A BG 605
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1 medoid: miga ZQ19A BG 605
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1 medoid: miga ZQ19A BG 605
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1 medoid: miga ZQ19A BG 605
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1 medoid: miga ZQ19A BG 605
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1 medoid: miga ZQ19A BG 605
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1 medoid: miga ZQ19A BG 605
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1 medoid: Pseudoteredinibacter isoporae GCA 014207695 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2 medoid: Simiduia aestuariiviva GCA 014192475 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-3 medoid: GCF 002162135 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-4 medoid: miga ZQ19A BG 605
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-5 medoid: Marinimicrobium agarilyticum DSM 16975 GCA 000423345 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-6 medoid: Marinibactrum halimedae GCA 021234875 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-7 medoid: Sessilibacter corallicola GCA 021290925 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-8 medoid: GCA 003265435 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-9 medoid: Exilibacterium tricleocarpae GCA 007004655 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-10 medoid: Granulosicoccus antarcticus IMCC3135 GCA 002215215 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-11 medoid: Marinagarivorans cellulosilyticus GCA 021655555 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-12 medoid: Ostreibacterium oceani GCA 009362845 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-13 medoid: Sinobacterium caligoides GCA 003752585 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-14 medoid: Umboniibacter marinipuniceus GCA 003688415 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-15 medoid: GCA 000209515 2
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-16 medoid: GCA 000961645 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-17 medoid: GCA 001723645 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-18 medoid: GCA 001735895 1
    
    1 dataset: GCA 001735895 1 (AAI: 100.0%)
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-19 medoid: GCA 001801465 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-20 medoid: GCA 001801745 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-21 medoid: GCA 002313265 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-22 medoid: GCA 002338385 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-23 medoid: GCA 002352565 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-24 medoid: GCA 002388905 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-25 medoid: GCA 002408105 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-26 medoid: GCF 014336955 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-27 medoid: GCA 002432655 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-28 medoid: GCA 002702725 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-29 medoid: GCA 002731295 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-30 medoid: GCA 002746115 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-31 medoid: GCA 003646405 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-32 medoid: GCA 003694425 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-33 medoid: GCA 003696645 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-34 medoid: GCA 006227085 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-35 medoid: GCA 007571095 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-36 medoid: GCA 009692385 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-37 medoid: GCA 011046015 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-38 medoid: GCA 012103495 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-39 medoid: GCA 013215905 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-40 medoid: GCA 014075255 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-41 medoid: GCA 014323765 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-42 medoid: GCA 015222725 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-43 medoid: GCA 016191205 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-44 medoid: GCA 016763235 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-45 medoid: GCA 016763565 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-46 medoid: GCA 018069525 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-47 medoid: GCA 018662305 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-48 medoid: GCA 019192445 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-49 medoid: GCA 902519405 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-50 medoid: GCA 905480565 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-51 medoid: GCF 000583135 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-52 medoid: GCF 017571465 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-53 medoid: asm GCA 900491035 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-54 medoid: asm GCA 900491045 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-55 medoid: miga ZQ19A BG 603
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2 medoid: GCA 018814965 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2 medoid: GCA 009885495 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-3 medoid: GCA 018812595 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2 medoid: GCA 902563055 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2 medoid: GCA 018703155 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-2 medoid: GCA 001750645 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-3 medoid: GCA 007570905 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-4 medoid: GCF 000300075 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-2 medoid: GCA 000953435 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-3 medoid: GCA 002333095 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-4 medoid: GCA 002722995 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-5 medoid: GCA 013215805 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-6 medoid: GCA 016874185 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-7 medoid: GCA 018402195 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-8 medoid: GCA 902601155 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-2 medoid: GCA 003513555 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-3 medoid: GCA 007693605 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-4 medoid: miga DE18A TARA PSE MAG 00115
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-2 medoid: Aestuariicella albida GCA 018863235 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-3 medoid: GCA 001802455 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-4 medoid: GCA 001898235 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-5 medoid: GCA 002480165 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-6 medoid: GCA 016763075 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-2 medoid: GCA 002082305 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-2 medoid: Thermochromatium tepidum ATCC 43061 GCA 009664085 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-3 medoid: GCA 903837345 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-4 medoid: GCA 902595225 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-1-5 medoid: GCA 007131295 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-1-2 medoid: GCA 902705865 1
    
    AAI clade 21-1-2-1-2 medoid: Endozoicomonas numazuensis GCA 000722635 1
    
    AAI clade 21-1-2-2 medoid: GCF 000023025 1
    
    AAI clade 21-1-2-3 medoid: GCA 903921135 1
  - AAI clade 21-1-3 medoid: GCF 900162825 1
  - AAI clade 21-1-4 medoid: GCA 017934275 1
  - AAI clade 21-1-5 medoid: GCF 008711525 1
  - AAI clade 21-1-6 medoid: GCF 002252045 1
  - AAI clade 21-1-7 medoid: GCA 003560975 1
  - AAI clade 21-1-8 medoid: GCF 902705855 1
  - AAI clade 21-1-9 medoid: Aquicella lusitana GCA 902459475 1
  - AAI clade 21-1-10 medoid: Desulfomicrobium macestii GCA 014873765 1
  - AAI clade 21-1-11 medoid: GCA 003233115 1
  - AAI clade 21-1-12 medoid: GCA 002729955 1
  - AAI clade 21-1-13 medoid: GCA 014762765 1
  - AAI clade 21-1-14 medoid: GCF 000377405 1
  - AAI clade 21-1-15 medoid: GCA 002483145 1
  - AAI clade 21-1-16 medoid: asm GCA 003646295 1
  - AAI clade 21-1-17 medoid: Porticoccus hydrocarbonoclasticus MCTG13d GCA 000744735 1
  - AAI clade 21-1-18 medoid: Thiothrix lacustris DSM 21227 GCA 000621325 1
  - AAI clade 21-1-19 medoid: GCA 009692245 1
  - AAI clade 21-1-20 medoid: GCF 003932495 1
  - AAI clade 21-1-21 medoid: GCA 013002025 1
  - AAI clade 21-1-22 medoid: GCA 002471665 1
  - AAI clade 21-1-23 medoid: GCA 013001045 1
  - AAI clade 21-1-24 medoid: GCA 000511875 1
  - AAI clade 21-1-25 medoid: GCA 002162755 1
  - AAI clade 21-1-26 medoid: GCA 012961165 1
  - AAI clade 21-1-27 medoid: GCA 902551695 1
  - AAI clade 21-1-28 medoid: GCA 014381985 1
  - AAI clade 21-1-29 medoid: GCA 002726445 1
  - AAI clade 21-1-30 medoid: GCA 002338445 1
  - AAI clade 21-1-31 medoid: GCA 004321845 1
  - AAI clade 21-1-32 medoid: GCA 018645765 1
  - AAI clade 21-1-33 medoid: GCA 902595845 1
  - AAI clade 21-1-34 medoid: GCA 009838035 1
- AAI clade 21-2 medoid: GCF 002940205 1
- AAI clade 21-3 medoid: GCA 902613175 1
- AAI clade 21-4 medoid: GCF 001650915 1
- AAI clade 21-5 medoid: GCF 013367775 1
- AAI clade 21-6 medoid: GCA 008081045 1
- AAI clade 21-7 medoid: GCA 902511025 1
- AAI clade 21-8 medoid: GCA 902547295 1
- AAI clade 21-9 medoid: GCA 902511575 1
- AAI clade 21-10 medoid: GCA 902606175 1
- AAI clade 21-11 medoid: GCA 902613475 1
- AAI clade 21-12 medoid: GCA 902540995 1
AAI clade 22 medoid: GCA 904374795 1
AAI clade 23 medoid: GCA 903955385 1
AAI clade 24 medoid: GCA 903887975 1
AAI clade 25 medoid: GCA 902602655 1
AAI clade 26 medoid: GCA 905235755 1
AAI clade 27 medoid: Anaerovorax odorimutans DSM 5092 GCA 000426305 1
AAI clade 28 medoid: GCA 903909555 1
AAI clade 29 medoid: Marinomonas aquimarina GCA 900089755 1
AAI clade 30 medoid: GCA 015061955 1
AAI clade 31 medoid: GCA 000421065 1
AAI clade 32 medoid: GCA 002438845 1
AAI clade 33 medoid: GCA 003602665 1
AAI clade 34 medoid: GCA 910585295 1
AAI clade 35 medoid: Nocardioides iriomotensis GCA 004168035 1
AAI clade 36 medoid: GCA 017608235 1
AAI clade 37 medoid: GCF 004332155 1
AAI clade 38 medoid: GCA 009712635 1
AAI clade 39 medoid: GCA 903926605 1
AAI clade 40 medoid: GCA 017645955 1
AAI clade 41 medoid: GCA 016793015 1
AAI clade 42 medoid: GCA 900538305 1
AAI clade 43 medoid: GCA 001002765 1
AAI clade 44 medoid: GCA 902559935 1
AAI clade 45 medoid: GCA 011371455 1
AAI clade 46 medoid: GCA 000435515 1
AAI clade 47 medoid: Anaerostipes butyraticus GCA 016586355 1
AAI clade 48 medoid: GCF 002835935 1
AAI clade 49 medoid: miga PS19A RaymondF 2016 P20E90 bin 24
AAI clade 50 medoid: GCA 002338255 1
AAI clade 51 medoid: Haloprofundus salinisoli GCA 020097815 1
AAI clade 52 medoid: GCA 900167925 1
AAI clade 53 medoid: GCA 900550065 1
AAI clade 54 medoid: GCA 002314915 1
AAI clade 55 medoid: Rhizorhabdus dicambivorans GCA 002355275 1
AAI clade 56 medoid: GCA 005882335 1
AAI clade 57 medoid: GCA 011065225 1
AAI clade 58 medoid: GCA 016781775 1
AAI clade 59 medoid: GCA 002362595 1
AAI clade 60 medoid: GCA 016214555 1
AAI clade 61 medoid: GCF 014764505 1
AAI clade 62 medoid: GCA 902623215 1
AAI clade 63 medoid: GCA 003514205 1
AAI clade 64 medoid: GCF 009707955 1
AAI clade 65 medoid: GCF 000348745 1
AAI clade 66 medoid: GCA 900772425 1
AAI clade 67 medoid: GCF 003590645 1
AAI clade 68 medoid: GCF 902506105 1
AAI clade 69 medoid: GCF 013407275 1
AAI clade 70 medoid: GCA 015494795 1
AAI clade 71 medoid: GCA 016709995 1
AAI clade 72 medoid: GCA 002493965 1
AAI clade 73 medoid: GCA 009469665 1
AAI clade 74 medoid: GCA 001799635 1
AAI clade 75 medoid: GCA 016650235 1
AAI clade 76 medoid: Ochrovirga pacifica GCA 000220525 2
AAI clade 77 medoid: GCA 009903855 1
AAI clade 78 medoid: GCA 019204045 1
AAI clade 79 medoid: GCA 902783375 1
AAI clade 80 medoid: GCF 000350105 1
AAI clade 81 medoid: GCA 903901345 1
AAI clade 82 medoid: GCA 015075425 1
AAI clade 83 medoid: GCA 001508835 1
AAI clade 84 medoid: GCA 017746715 1
AAI clade 85 medoid: Nocardioides plantarum GCA 006346395 1
AAI clade 86 medoid: GCA 017438285 1
AAI clade 87 medoid: GCA 002712945 1
AAI clade 88 medoid: GCF 002214625 1
AAI clade 89 medoid: GCA 902773215 1
AAI clade 90 medoid: GCA 002723385 1
AAI clade 91 medoid: GCA 019113455 1
AAI clade 92 medoid: GCA 016286935 1
AAI clade 93 medoid: GCA 003566775 1

A collaboration between