AAI-based medoid clustering
The AAI clusters provide a good overview of the above-species structure of the datasets and facilitate taxonomic classification.
-
AAI clade 1
medoid: Brucella daejeonensis GCA 014199265 1
-
AAI clade 2
medoid: GCA 017448355 1
-
AAI clade 3
medoid: GCA 017467885 1
-
AAI clade 4
medoid: Pedobacter duraquae GCA 004362245 1
-
AAI clade 5
medoid: Streptomyces angustmyceticus GCA 002154415 1
-
AAI clade 6
medoid: Pseudomonas migulae GCA 024169545 1
-
AAI clade 7
medoid: miga SS18A Bin 41 contigs
-
AAI clade 8
medoid: Mucilaginibacter ginkgonis GCA 009754905 2
-
AAI clade 9
medoid: GCA 900755995 1
-
AAI clade 10
medoid: GCF 013113835 1
-
AAI clade 11
medoid: Secundilactobacillus odoratitofui DSM 19909 JCM 15043 GCA 001434895 1
-
AAI clade 12
medoid: GCA 016840965 1
-
AAI clade 13
medoid: GCA 017622235 1
-
AAI clade 14
medoid: GCA 904390925 1
-
AAI clade 15
medoid: GCA 002375985 1
-
AAI clade 16
medoid: GCA 003963015 1
-
AAI clade 17
medoid: GCA 001771585 1
-
AAI clade 18
medoid: GCF 018398895 1
-
AAI clade 19
medoid: GCA 001295775 1
-
AAI clade 20
medoid: Qipengyuania aquimaris GCA 009827445 1
-
AAI clade 21
medoid: GCF 009363535 1
-
AAI clade 21-1
medoid: miga ZQ19A BG 605
-
AAI clade 21-1-1
medoid: Solimonas flava DSM 18980 GCA 000426685 1
-
AAI clade 21-1-2
medoid: miga ZQ19A BG 605
-
AAI clade 21-1-2-1
medoid: miga ZQ19A BG 605
-
AAI clade 21-1-2-1-1
medoid: miga ZQ19A BG 605
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1
medoid: miga ZQ19A BG 605
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1
medoid: miga ZQ19A BG 605
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1
medoid: miga ZQ19A BG 605
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1
medoid: miga ZQ19A BG 605
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1
medoid: miga ZQ19A BG 605
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1
medoid: miga ZQ19A BG 605
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1
medoid: miga ZQ19A BG 605
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1
medoid: miga ZQ19A BG 605
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1
medoid: miga ZQ19A BG 605
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1
medoid: miga ZQ19A BG 605
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1
medoid: miga ZQ19A BG 605
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1
medoid: Pseudoteredinibacter isoporae GCA 014207695 1
1 dataset: Pseudoteredinibacter isoporae GCA 014207695 1 (AAI: 100.0%)
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2
medoid: Simiduia aestuariiviva GCA 014192475 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-3
medoid: GCF 002162135 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-4
medoid: miga ZQ19A BG 605
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-5
medoid: Marinimicrobium agarilyticum DSM 16975 GCA 000423345 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-6
medoid: Marinibactrum halimedae GCA 021234875 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-7
medoid: Sessilibacter corallicola GCA 021290925 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-8
medoid: GCA 003265435 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-9
medoid: Exilibacterium tricleocarpae GCA 007004655 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-10
medoid: Granulosicoccus antarcticus IMCC3135 GCA 002215215 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-11
medoid: Marinagarivorans cellulosilyticus GCA 021655555 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-12
medoid: Ostreibacterium oceani GCA 009362845 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-13
medoid: Sinobacterium caligoides GCA 003752585 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-14
medoid: Umboniibacter marinipuniceus GCA 003688415 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-15
medoid: GCA 000209515 2
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-16
medoid: GCA 000961645 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-17
medoid: GCA 001723645 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-18
medoid: GCA 001735895 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-19
medoid: GCA 001801465 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-20
medoid: GCA 001801745 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-21
medoid: GCA 002313265 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-22
medoid: GCA 002338385 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-23
medoid: GCA 002352565 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-24
medoid: GCA 002388905 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-25
medoid: GCA 002408105 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-26
medoid: GCF 014336955 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-27
medoid: GCA 002432655 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-28
medoid: GCA 002702725 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-29
medoid: GCA 002731295 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-30
medoid: GCA 002746115 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-31
medoid: GCA 003646405 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-32
medoid: GCA 003694425 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-33
medoid: GCA 003696645 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-34
medoid: GCA 006227085 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-35
medoid: GCA 007571095 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-36
medoid: GCA 009692385 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-37
medoid: GCA 011046015 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-38
medoid: GCA 012103495 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-39
medoid: GCA 013215905 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-40
medoid: GCA 014075255 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-41
medoid: GCA 014323765 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-42
medoid: GCA 015222725 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-43
medoid: GCA 016191205 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-44
medoid: GCA 016763235 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-45
medoid: GCA 016763565 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-46
medoid: GCA 018069525 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-47
medoid: GCA 018662305 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-48
medoid: GCA 019192445 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-49
medoid: GCA 902519405 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-50
medoid: GCA 905480565 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-51
medoid: GCF 000583135 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-52
medoid: GCF 017571465 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-53
medoid: asm GCA 900491035 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-54
medoid: asm GCA 900491045 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-55
medoid: miga ZQ19A BG 603
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1
medoid: Pseudoteredinibacter isoporae GCA 014207695 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2
medoid: GCA 018814965 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1
medoid: miga ZQ19A BG 605
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2
medoid: GCA 009885495 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-3
medoid: GCA 018812595 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1
medoid: miga ZQ19A BG 605
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2
medoid: GCA 902563055 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1
medoid: miga ZQ19A BG 605
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2
medoid: GCA 018703155 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1
medoid: miga ZQ19A BG 605
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-2
medoid: GCA 001750645 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-3
medoid: GCA 007570905 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-4
medoid: GCF 000300075 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1
medoid: miga ZQ19A BG 605
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-2
medoid: GCA 000953435 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-3
medoid: GCA 002333095 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-4
medoid: GCA 002722995 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-5
medoid: GCA 013215805 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-6
medoid: GCA 016874185 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-7
medoid: GCA 018402195 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-8
medoid: GCA 902601155 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1
medoid: miga ZQ19A BG 605
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-2
medoid: GCA 003513555 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-3
medoid: GCA 007693605 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-4
medoid: miga DE18A TARA PSE MAG 00115
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1-1
medoid: miga ZQ19A BG 605
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-2
medoid: Aestuariicella albida GCA 018863235 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-3
medoid: GCA 001802455 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-4
medoid: GCA 001898235 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-5
medoid: GCA 002480165 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-6
medoid: GCA 016763075 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1-1
medoid: miga ZQ19A BG 605
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-2
medoid: GCA 002082305 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1-1
medoid: miga ZQ19A BG 605
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-2
medoid: Thermochromatium tepidum ATCC 43061 GCA 009664085 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-3
medoid: GCA 903837345 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-4
medoid: GCA 902595225 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-5
medoid: GCA 007131295 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1-1
medoid: miga ZQ19A BG 605
-
AAI clade 21-1-2-1-1-2
medoid: GCA 902705865 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1-1
medoid: miga ZQ19A BG 605
-
AAI clade 21-1-2-1-2
medoid: Endozoicomonas numazuensis GCA 000722635 1
-
AAI clade 21-1-2-1-1
medoid: miga ZQ19A BG 605
-
AAI clade 21-1-2-2
medoid: GCF 000023025 1
-
AAI clade 21-1-2-3
medoid: GCA 903921135 1
-
AAI clade 21-1-2-1
medoid: miga ZQ19A BG 605
-
AAI clade 21-1-3
medoid: GCF 900162825 1
-
AAI clade 21-1-4
medoid: GCA 017934275 1
-
AAI clade 21-1-5
medoid: GCF 008711525 1
-
AAI clade 21-1-6
medoid: GCF 002252045 1
-
AAI clade 21-1-7
medoid: GCA 003560975 1
-
AAI clade 21-1-8
medoid: GCF 902705855 1
-
AAI clade 21-1-9
medoid: Aquicella lusitana GCA 902459475 1
-
AAI clade 21-1-10
medoid: Desulfomicrobium macestii GCA 014873765 1
-
AAI clade 21-1-11
medoid: GCA 003233115 1
-
AAI clade 21-1-12
medoid: GCA 002729955 1
-
AAI clade 21-1-13
medoid: GCA 014762765 1
-
AAI clade 21-1-14
medoid: GCF 000377405 1
-
AAI clade 21-1-15
medoid: GCA 002483145 1
-
AAI clade 21-1-16
medoid: asm GCA 003646295 1
-
AAI clade 21-1-17
medoid: Porticoccus hydrocarbonoclasticus MCTG13d GCA 000744735 1
-
AAI clade 21-1-18
medoid: Thiothrix lacustris DSM 21227 GCA 000621325 1
-
AAI clade 21-1-19
medoid: GCA 009692245 1
-
AAI clade 21-1-20
medoid: GCF 003932495 1
-
AAI clade 21-1-21
medoid: GCA 013002025 1
-
AAI clade 21-1-22
medoid: GCA 002471665 1
-
AAI clade 21-1-23
medoid: GCA 013001045 1
-
AAI clade 21-1-24
medoid: GCA 000511875 1
-
AAI clade 21-1-25
medoid: GCA 002162755 1
-
AAI clade 21-1-26
medoid: GCA 012961165 1
-
AAI clade 21-1-27
medoid: GCA 902551695 1
-
AAI clade 21-1-28
medoid: GCA 014381985 1
-
AAI clade 21-1-29
medoid: GCA 002726445 1
-
AAI clade 21-1-30
medoid: GCA 002338445 1
-
AAI clade 21-1-31
medoid: GCA 004321845 1
-
AAI clade 21-1-32
medoid: GCA 018645765 1
-
AAI clade 21-1-33
medoid: GCA 902595845 1
-
AAI clade 21-1-34
medoid: GCA 009838035 1
-
AAI clade 21-1-1
medoid: Solimonas flava DSM 18980 GCA 000426685 1
-
AAI clade 21-2
medoid: GCF 002940205 1
-
AAI clade 21-3
medoid: GCA 902613175 1
-
AAI clade 21-4
medoid: GCF 001650915 1
-
AAI clade 21-5
medoid: GCF 013367775 1
-
AAI clade 21-6
medoid: GCA 008081045 1
-
AAI clade 21-7
medoid: GCA 902511025 1
-
AAI clade 21-8
medoid: GCA 902547295 1
-
AAI clade 21-9
medoid: GCA 902511575 1
-
AAI clade 21-10
medoid: GCA 902606175 1
-
AAI clade 21-11
medoid: GCA 902613475 1
-
AAI clade 21-12
medoid: GCA 902540995 1
-
AAI clade 21-1
medoid: miga ZQ19A BG 605
-
AAI clade 22
medoid: GCA 904374795 1
-
AAI clade 23
medoid: GCA 903955385 1
-
AAI clade 24
medoid: GCA 903887975 1
-
AAI clade 25
medoid: GCA 902602655 1
-
AAI clade 26
medoid: GCA 905235755 1
-
AAI clade 27
medoid: Anaerovorax odorimutans DSM 5092 GCA 000426305 1
-
AAI clade 28
medoid: GCA 903909555 1
-
AAI clade 29
medoid: Marinomonas aquimarina GCA 900089755 1
-
AAI clade 30
medoid: GCA 015061955 1
-
AAI clade 31
medoid: GCA 000421065 1
-
AAI clade 32
medoid: GCA 002438845 1
-
AAI clade 33
medoid: GCA 003602665 1
-
AAI clade 34
medoid: GCA 910585295 1
-
AAI clade 35
medoid: Nocardioides iriomotensis GCA 004168035 1
-
AAI clade 36
medoid: GCA 017608235 1
-
AAI clade 37
medoid: GCF 004332155 1
-
AAI clade 38
medoid: GCA 009712635 1
-
AAI clade 39
medoid: GCA 903926605 1
-
AAI clade 40
medoid: GCA 017645955 1
-
AAI clade 41
medoid: GCA 016793015 1
-
AAI clade 42
medoid: GCA 900538305 1
-
AAI clade 43
medoid: GCA 001002765 1
-
AAI clade 44
medoid: GCA 902559935 1
-
AAI clade 45
medoid: GCA 011371455 1
-
AAI clade 46
medoid: GCA 000435515 1
-
AAI clade 47
medoid: Anaerostipes butyraticus GCA 016586355 1
-
AAI clade 48
medoid: GCF 002835935 1
-
AAI clade 49
medoid: miga PS19A RaymondF 2016 P20E90 bin 24
-
AAI clade 50
medoid: GCA 002338255 1
-
AAI clade 51
medoid: Haloprofundus salinisoli GCA 020097815 1
-
AAI clade 52
medoid: GCA 900167925 1
-
AAI clade 53
medoid: GCA 900550065 1
-
AAI clade 54
medoid: GCA 002314915 1
-
AAI clade 55
medoid: Rhizorhabdus dicambivorans GCA 002355275 1
-
AAI clade 56
medoid: GCA 005882335 1
-
AAI clade 57
medoid: GCA 011065225 1
-
AAI clade 58
medoid: GCA 016781775 1
-
AAI clade 59
medoid: GCA 002362595 1
-
AAI clade 60
medoid: GCA 016214555 1
-
AAI clade 61
medoid: GCF 014764505 1
-
AAI clade 62
medoid: GCA 902623215 1
-
AAI clade 63
medoid: GCA 003514205 1
-
AAI clade 64
medoid: GCF 009707955 1
-
AAI clade 65
medoid: GCF 000348745 1
-
AAI clade 66
medoid: GCA 900772425 1
-
AAI clade 67
medoid: GCF 003590645 1
-
AAI clade 68
medoid: GCF 902506105 1
-
AAI clade 69
medoid: GCF 013407275 1
-
AAI clade 70
medoid: GCA 015494795 1
-
AAI clade 71
medoid: GCA 016709995 1
-
AAI clade 72
medoid: GCA 002493965 1
-
AAI clade 73
medoid: GCA 009469665 1
-
AAI clade 74
medoid: GCA 001799635 1
-
AAI clade 75
medoid: GCA 016650235 1
-
AAI clade 76
medoid: Ochrovirga pacifica GCA 000220525 2
-
AAI clade 77
medoid: GCA 009903855 1
-
AAI clade 78
medoid: GCA 019204045 1
-
AAI clade 79
medoid: GCA 902783375 1
-
AAI clade 80
medoid: GCF 000350105 1
-
AAI clade 81
medoid: GCA 903901345 1
-
AAI clade 82
medoid: GCA 015075425 1
-
AAI clade 83
medoid: GCA 001508835 1
-
AAI clade 84
medoid: GCA 017746715 1
-
AAI clade 85
medoid: Nocardioides plantarum GCA 006346395 1
-
AAI clade 86
medoid: GCA 017438285 1
-
AAI clade 87
medoid: GCA 002712945 1
-
AAI clade 88
medoid: GCF 002214625 1
-
AAI clade 89
medoid: GCA 902773215 1
-
AAI clade 90
medoid: GCA 002723385 1
-
AAI clade 91
medoid: GCA 019113455 1
-
AAI clade 92
medoid: GCA 016286935 1
-
AAI clade 93
medoid: GCA 003566775 1