AAI-based medoid clustering

The AAI clusters provide a good overview of the above-species structure of the datasets and facilitate taxonomic classification.

• AAI clade 1 medoid: GCA 017502845 1
• AAI clade 2 medoid: GCA 002434265 1
• AAI clade 3 medoid: GCA 013002175 1
• AAI clade 4 medoid: GCA 900110395 1
• AAI clade 5 medoid: GCA 012798955 1
• AAI clade 6 medoid: GCA 013415575 1
• AAI clade 7 medoid: GCF 008638345 1
• AAI clade 8 medoid: GCF 000807255 1
  • AAI clade 8-1 medoid: GCA 904418825 1
    • AAI clade 8-1-1 medoid: GCA 904418825 1
      • AAI clade 8-1-1-1 medoid: GCF 900106845 1
      • AAI clade 8-1-1-2 medoid: GCF 900142285 1
        • AAI clade 8-1-1-2-1 medoid: GCA 001788835 1
        • AAI clade 8-1-1-2-2 medoid: GCA 002315535 1
        • AAI clade 8-1-1-2-3 medoid: GCA 002402455 1
        • AAI clade 8-1-1-2-4 medoid: GCA 002428805 1
        • AAI clade 8-1-1-2-5 medoid: GCA 002452745 1
        • AAI clade 8-1-1-2-6 medoid: GCA 002792535 1
        • AAI clade 8-1-1-2-7 medoid: GCA 003230635 1
        • AAI clade 8-1-1-2-8 medoid: GCA 003251775 1
        • AAI clade 8-1-1-2-9 medoid: GCA 003482695 1
        • AAI clade 8-1-1-2-10 medoid: GCA 003518125 1
        • AAI clade 8-1-1-2-11 medoid: GCA 011390155 1
        • AAI clade 8-1-1-2-12 medoid: GCA 007120165 1
        • AAI clade 8-1-1-2-13 medoid: GCA 009881125 1
        • AAI clade 8-1-1-2-14 medoid: GCA 012800145 1
        • AAI clade 8-1-1-2-15 medoid: GCA 013202385 1
        • AAI clade 8-1-1-2-16 medoid: GCA 013824265 1
        • AAI clade 8-1-1-2-17 medoid: GCA 014236755 1
        • AAI clade 8-1-1-2-18 medoid: GCA 900318105 1
        • AAI clade 8-1-1-2-19 medoid: GCA 015232535 1
        • AAI clade 8-1-1-2-20 medoid: GCA 016206505 1
        • AAI clade 8-1-1-2-21 medoid: GCA 016302925 1
        • AAI clade 8-1-1-2-22 medoid: GCA 016650175 1
        • AAI clade 8-1-1-2-23 medoid: GCA 016699145 1
        • AAI clade 8-1-1-2-24 medoid: GCA 016934535 1
        • AAI clade 8-1-1-2-25 medoid: GCA 017116025 1
        • AAI clade 8-1-1-2-26 medoid: GCA 017515705 1
        • AAI clade 8-1-1-2-27 medoid: GCA 017543805 1
        • AAI clade 8-1-1-2-28 medoid: GCF 001562415 1
        • AAI clade 8-1-1-2-29 medoid: GCA 018623505 1
        • AAI clade 8-1-1-2-30 medoid: GCA 018818345 1
        • AAI clade 8-1-1-2-31 medoid: GCA 903839975 1
        • AAI clade 8-1-1-2-32 medoid: GCA 905372035 1
          1 dataset: GCA 905372035 1 (AAI: 100.0%)
        • AAI clade 8-1-1-2-33 medoid: GCF 002119425 1
        • AAI clade 8-1-1-2-34 medoid: GCF 900167445 1
        • AAI clade 8-1-1-2-35 medoid: GCF 904398315 1
    • AAI clade 8-1-2 medoid: GCF 001299635 1
    • AAI clade 8-1-3 medoid: GCF 000439105 1
  • AAI clade 8-2 medoid: GCF 016316925 1
  • AAI clade 8-3 medoid: GCF 900113965 1
  • AAI clade 8-4 medoid: GCA 900547475 1
  • AAI clade 8-5 medoid: GCA 012728125 1
  • AAI clade 8-6 medoid: GCA 001000865 1
  • AAI clade 8-7 medoid: GCA 002786595 1
  • AAI clade 8-8 medoid: GCF 000173795 1
  • AAI clade 8-9 medoid: GCF 000159695 1
  • AAI clade 8-10 medoid: GCF 017161305 1
  • AAI clade 8-11 medoid: GCA 009785215 1
  • AAI clade 8-12 medoid: GCF 018223745 1
  • AAI clade 8-13 medoid: GCF 000266865 1
  • AAI clade 8-14 medoid: GCA 016281495 1
  • AAI clade 8-15 medoid: GCF 018861905 1
  • AAI clade 8-16 medoid: GCA 015056885 1
  • AAI clade 8-17 medoid: GCA 017936375 1
  • AAI clade 8-18 medoid: GCF 001436755 1
  • AAI clade 8-19 medoid: GCF 018437235 1
• AAI clade 9 medoid: GCF 001050135 1
• AAI clade 10 medoid: GCA 002717245 1
• AAI clade 11 medoid: GCA 017478625 1
• AAI clade 12 medoid: GCA 009773355 1
• AAI clade 13 medoid: GCA 905200435 1
• AAI clade 14 medoid: GCA 017516885 1
• AAI clade 15 medoid: GCA 004321885 1
• AAI clade 16 medoid: GCA 905236305 1
• AAI clade 17 medoid: GCA 017648525 1
• AAI clade 18 medoid: GCA 019113065 1
• AAI clade 19 medoid: GCA 016795075 1
• AAI clade 20 medoid: GCF 001467025 1
• AAI clade 21 medoid: GCA 017642855 1
• AAI clade 22 medoid: GCA 017408305 1
• AAI clade 23 medoid: GCA 002436405 1