AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-27

AAI-based medoid clustering

The AAI clusters provide a good overview of the above-species structure of the datasets and facilitate taxonomic classification.

AAI clade 1 medoid: GCA 017502845 1
AAI clade 2 medoid: GCA 002434265 1
AAI clade 3 medoid: GCA 013002175 1
AAI clade 4 medoid: GCA 900110395 1
AAI clade 5 medoid: GCA 012798955 1
- AAI clade 5-1 medoid: GCA 017449415 1
- AAI clade 5-2 medoid: GCF 000381045 1
- AAI clade 5-3 medoid: GCF 015206895 1
- AAI clade 5-4 medoid: GCA 003280985 1
  - AAI clade 5-4-1 medoid: GCA 003280985 1
    
    AAI clade 5-4-1-1 medoid: GCA 003280985 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1 medoid: GCA 003280985 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1 medoid: GCA 003280985 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1 medoid: GCA 003280985 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1 medoid: GCA 003280985 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-1 medoid: GCA 902574425 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2 medoid: GCA 003280985 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1 medoid: GCA 003280985 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-1 medoid: GCA 003280985 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1 medoid: GCA 003280985 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1 medoid: GCA 003280985 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1 medoid: GCA 003280985 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1 medoid: GCA 003280985 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1 medoid: GCA 003280985 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1 medoid: GCA 003280985 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1 medoid: GCA 003280985 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1 medoid: GCA 003280985 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1 medoid: GCA 000634195 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2 medoid: GCA 000634215 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-3 medoid: GCA 003280985 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-4 medoid: GCA 000635015 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-5 medoid: GCA 003210155 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-6 medoid: GCA 003211955 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-7 medoid: GCA 003212655 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-8 medoid: GCA 003213255 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-9 medoid: GCA 003214115 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-10 medoid: GCA 003216455 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-11 medoid: GCA 003278545 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-12 medoid: GCA 003278735 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-13 medoid: GCA 003278855 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-14 medoid: GCA 003278895 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-15 medoid: GCA 003278955 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-16 medoid: GCA 003279105 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-17 medoid: GCA 003280515 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-18 medoid: GCA 003280895 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-19 medoid: GCA 003281255 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-20 medoid: GCA 003281335 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-21 medoid: GCA 003281605 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-22 medoid: GCA 902518475 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-23 medoid: GCA 902520485 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-24 medoid: GCA 902521995 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-25 medoid: GCA 902522795 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-26 medoid: GCA 902535185 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-27 medoid: GCA 902572075 1
    
    1 dataset: GCA 902572075 1 (AAI: 100.0%)
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-28 medoid: GCA 902573335 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-29 medoid: GCA 902591275 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-30 medoid: GCA 902615165 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-31 medoid: GCA 902618795 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-32 medoid: GCA 902622625 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-33 medoid: GCF 000015645 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-34 medoid: GCF 000015965 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-35 medoid: GCF 000757845 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-36 medoid: GCF 000760035 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-37 medoid: GCF 002025865 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-38 medoid: GCF 002026005 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-39 medoid: GCF 017696315 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2 medoid: GCA 003278925 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-3 medoid: GCF 002025945 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-2 medoid: GCA 003209375 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-3 medoid: GCA 003213235 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-4 medoid: GCA 003281505 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-5 medoid: GCA 003281685 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-6 medoid: GCA 902536545 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-7 medoid: GCA 902594875 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-8 medoid: GCA 902595175 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-2 medoid: GCA 003281585 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-3 medoid: GCF 001180285 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-2 medoid: GCA 003278875 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-3 medoid: GCA 003281385 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-2 medoid: GCA 003279055 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-3 medoid: GCA 902564235 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-4 medoid: GCA 902574405 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-2 medoid: GCA 003209425 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-3 medoid: GCA 003281625 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-2 medoid: GCA 003209585 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-3 medoid: GCA 003216635 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-4 medoid: GCA 003278525 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-1-1-5 medoid: GCA 902539115 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-1-2 medoid: GCA 003216535 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-1-3 medoid: GCF 001180245 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-2 medoid: GCA 003281185 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-3 medoid: GCA 003281485 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-4 medoid: GCA 902534685 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-1-5 medoid: GCA 902578845 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-2-2 medoid: GCA 003279845 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-1-3 medoid: GCF 001180305 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-1-2 medoid: GCA 902525075 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-1-2 medoid: GCA 902596585 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-1-2 medoid: GCA 003213275 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-2 medoid: GCA 003213855 1
    
    AAI clade 5-4-1-1-3 medoid: GCA 902570945 1
    
    AAI clade 5-4-1-2 medoid: GCA 003214055 1
  - AAI clade 5-4-2 medoid: GCA 902624085 1
  - AAI clade 5-4-3 medoid: GCA 003211335 1
  - AAI clade 5-4-4 medoid: GCA 003213355 1
  - AAI clade 5-4-5 medoid: GCA 003212695 1
- AAI clade 5-5 medoid: GCF 900142025 1
- AAI clade 5-6 medoid: GCF 014205895 1
- AAI clade 5-7 medoid: GCA 002747175 1
- AAI clade 5-8 medoid: GCF 002532075 1
- AAI clade 5-9 medoid: GCA 016179875 1
- AAI clade 5-10 medoid: GCA 002869845 2
- AAI clade 5-11 medoid: GCA 016235875 1
- AAI clade 5-12 medoid: GCA 905612265 1
- AAI clade 5-13 medoid: GCF 014201315 1
- AAI clade 5-14 medoid: GCA 003167255 1
- AAI clade 5-15 medoid: GCA 013152765 1
- AAI clade 5-16 medoid: GCA 009845545 1
- AAI clade 5-17 medoid: GCF 003003925 1
- AAI clade 5-18 medoid: GCA 016182975 1
- AAI clade 5-19 medoid: GCA 015484715 1
- AAI clade 5-20 medoid: GCA 017510075 1
- AAI clade 5-21 medoid: GCA 015222205 1
- AAI clade 5-22 medoid: GCA 013813355 1
- AAI clade 5-23 medoid: GCA 016706275 1
- AAI clade 5-24 medoid: GCA 003554615 1
- AAI clade 5-25 medoid: GCA 003448875 1
- AAI clade 5-26 medoid: GCA 017622235 1
- AAI clade 5-27 medoid: GCA 001919715 1
- AAI clade 5-28 medoid: GCA 017883385 1
- AAI clade 5-29 medoid: GCA 001805765 1
- AAI clade 5-30 medoid: GCF 002251945 1
- AAI clade 5-31 medoid: GCA 005888435 1
- AAI clade 5-32 medoid: GCA 003222055 1
- AAI clade 5-33 medoid: GCA 005889085 1
- AAI clade 5-34 medoid: GCA 016741895 1
AAI clade 6 medoid: GCA 013415575 1
AAI clade 7 medoid: GCF 008638345 1
AAI clade 8 medoid: GCF 000807255 1
AAI clade 9 medoid: GCF 001050135 1
AAI clade 10 medoid: GCA 002717245 1
AAI clade 11 medoid: GCA 017478625 1
AAI clade 12 medoid: GCA 009773355 1
AAI clade 13 medoid: GCA 905200435 1
AAI clade 14 medoid: GCA 017516885 1
AAI clade 15 medoid: GCA 004321885 1
AAI clade 16 medoid: GCA 905236305 1
AAI clade 17 medoid: GCA 017648525 1
AAI clade 18 medoid: GCA 019113065 1
AAI clade 19 medoid: GCA 016795075 1
AAI clade 20 medoid: GCF 001467025 1
AAI clade 21 medoid: GCA 017642855 1
AAI clade 22 medoid: GCA 017408305 1
AAI clade 23 medoid: GCA 002436405 1

AAI-based medoid clustering

A collaboration between