AAI-based medoid clustering

The AAI clusters provide a good overview of the above-species structure of the datasets and facilitate taxonomic classification.

  • AAI clade 1 medoid: GCA 017502845 1
  • AAI clade 2 medoid: GCA 002434265 1
  • AAI clade 3 medoid: GCA 013002175 1
  • AAI clade 4 medoid: GCA 900110395 1
    • AAI clade 4-1 medoid: GCF 017302985 1
    • AAI clade 4-2 medoid: GCF 002245955 1
      • AAI clade 4-2-1 medoid: GCF 900177515 1
      • AAI clade 4-2-2 medoid: GCF 000948415 1
      • AAI clade 4-2-3 medoid: GCF 900093605 1
        • AAI clade 4-2-3-1 medoid: GCF 900093605 1
          • AAI clade 4-2-3-1-1 medoid: GCF 900093605 1
            • AAI clade 4-2-3-1-1-1 medoid: GCF 900093605 1
              • AAI clade 4-2-3-1-1-1-1 medoid: GCA 905182615 1
              • AAI clade 4-2-3-1-1-1-2 medoid: GCF 900093605 1
                • AAI clade 4-2-3-1-1-1-2-1 medoid: GCF 900093605 1
                • AAI clade 4-2-3-1-1-1-2-2 medoid: GCA 002162915 1
                • AAI clade 4-2-3-1-1-1-2-3 medoid: GCF 017313765 1
                • AAI clade 4-2-3-1-1-1-2-4 medoid: GCA 002239065 1
                • AAI clade 4-2-3-1-1-1-2-5 medoid: GCA 002257235 1
                • AAI clade 4-2-3-1-1-1-2-6 medoid: GCA 002340345 1
                • AAI clade 4-2-3-1-1-1-2-7 medoid: GCA 002348365 1
                • AAI clade 4-2-3-1-1-1-2-8 medoid: GCA 002423185 1
                • AAI clade 4-2-3-1-1-1-2-9 medoid: GCA 002632265 1
                • AAI clade 4-2-3-1-1-1-2-10 medoid: GCA 002717225 1
                • AAI clade 4-2-3-1-1-1-2-11 medoid: GCA 002724395 1
                • AAI clade 4-2-3-1-1-1-2-12 medoid: GCA 002724635 1
                • AAI clade 4-2-3-1-1-1-2-13 medoid: GCA 002725625 1
                • AAI clade 4-2-3-1-1-1-2-14 medoid: GCA 002787635 1
                • AAI clade 4-2-3-1-1-1-2-15 medoid: GCA 002937995 1
                • AAI clade 4-2-3-1-1-1-2-16 medoid: GCA 002938035 1
                  1 dataset: GCA 002938035 1 (AAI: 100.0%)
                • AAI clade 4-2-3-1-1-1-2-17 medoid: GCA 002938125 1
                • AAI clade 4-2-3-1-1-1-2-18 medoid: GCA 003212315 1
                • AAI clade 4-2-3-1-1-1-2-19 medoid: GCA 003230015 1
                • AAI clade 4-2-3-1-1-1-2-20 medoid: GCA 003280605 1
                • AAI clade 4-2-3-1-1-1-2-21 medoid: GCA 003576685 1
                • AAI clade 4-2-3-1-1-1-2-22 medoid: GCA 003577275 1
                • AAI clade 4-2-3-1-1-1-2-23 medoid: GCF 003344765 1
                • AAI clade 4-2-3-1-1-1-2-24 medoid: GCA 007694015 1
                • AAI clade 4-2-3-1-1-1-2-25 medoid: GCA 007695045 1
                • AAI clade 4-2-3-1-1-1-2-26 medoid: GCA 009694085 1
                • AAI clade 4-2-3-1-1-1-2-27 medoid: GCA 009773045 1
                • AAI clade 4-2-3-1-1-1-2-28 medoid: GCA 009936825 1
                • AAI clade 4-2-3-1-1-1-2-29 medoid: GCA 010031785 1
                • AAI clade 4-2-3-1-1-1-2-30 medoid: GCA 016699305 1
                • AAI clade 4-2-3-1-1-1-2-31 medoid: GCA 016722635 1
                • AAI clade 4-2-3-1-1-1-2-32 medoid: GCA 016793165 1
                • AAI clade 4-2-3-1-1-1-2-33 medoid: GCA 016869935 1
                • AAI clade 4-2-3-1-1-1-2-34 medoid: GCA 016870095 1
                • AAI clade 4-2-3-1-1-1-2-35 medoid: GCA 017307065 1
                • AAI clade 4-2-3-1-1-1-2-36 medoid: GCF 009711445 1
                • AAI clade 4-2-3-1-1-1-2-37 medoid: GCA 018063245 1
                • AAI clade 4-2-3-1-1-1-2-38 medoid: GCA 018660265 1
                • AAI clade 4-2-3-1-1-1-2-39 medoid: GCA 018660965 1
                • AAI clade 4-2-3-1-1-1-2-40 medoid: GCA 018662925 1
                • AAI clade 4-2-3-1-1-1-2-41 medoid: GCA 018699755 1
                • AAI clade 4-2-3-1-1-1-2-42 medoid: GCA 018700655 1
                • AAI clade 4-2-3-1-1-1-2-43 medoid: GCA 902826885 1
                • AAI clade 4-2-3-1-1-1-2-44 medoid: GCF 000730245 1
                • AAI clade 4-2-3-1-1-1-2-45 medoid: GCF 002924445 1
                • AAI clade 4-2-3-1-1-1-2-46 medoid: GCF 003173035 1
              • AAI clade 4-2-3-1-1-1-3 medoid: GCA 001897445 1
              • AAI clade 4-2-3-1-1-1-4 medoid: GCA 002325375 1
              • AAI clade 4-2-3-1-1-1-5 medoid: GCA 013911655 1
              • AAI clade 4-2-3-1-1-1-6 medoid: GCA 002393025 1
              • AAI clade 4-2-3-1-1-1-7 medoid: GCA 015487905 1
              • AAI clade 4-2-3-1-1-1-8 medoid: GCA 018062985 1
            • AAI clade 4-2-3-1-1-2 medoid: GCA 015654915 1
          • AAI clade 4-2-3-1-2 medoid: GCF 002930195 1
        • AAI clade 4-2-3-2 medoid: GCF 012102705 1
        • AAI clade 4-2-3-3 medoid: GCA 001897795 1
        • AAI clade 4-2-3-4 medoid: GCA 002421905 1
        • AAI clade 4-2-3-5 medoid: GCA 002359735 1
        • AAI clade 4-2-3-6 medoid: GCA 016777585 1
        • AAI clade 4-2-3-7 medoid: GCA 002168225 1
        • AAI clade 4-2-3-8 medoid: GCA 002238905 1
        • AAI clade 4-2-3-9 medoid: GCA 003524565 1
        • AAI clade 4-2-3-10 medoid: GCA 018660225 1
        • AAI clade 4-2-3-11 medoid: GCA 002732845 1
        • AAI clade 4-2-3-12 medoid: GCA 002434595 1
        • AAI clade 4-2-3-13 medoid: GCA 018662005 1
        • AAI clade 4-2-3-14 medoid: GCF 014925385 1
        • AAI clade 4-2-3-15 medoid: GCA 009693785 1
        • AAI clade 4-2-3-16 medoid: GCA 011523655 1
        • AAI clade 4-2-3-17 medoid: GCA 014238535 1
        • AAI clade 4-2-3-18 medoid: GCA 017457425 1
        • AAI clade 4-2-3-19 medoid: GCA 903893805 1
        • AAI clade 4-2-3-20 medoid: GCA 900550445 1
      • AAI clade 4-2-4 medoid: GCF 002105535 1
      • AAI clade 4-2-5 medoid: GCF 000312425 1
      • AAI clade 4-2-6 medoid: GCA 015232705 1
    • AAI clade 4-3 medoid: GCF 900094625 1
    • AAI clade 4-4 medoid: GCA 009773055 1
    • AAI clade 4-5 medoid: GCF 900094605 1
    • AAI clade 4-6 medoid: GCF 004302915 1
    • AAI clade 4-7 medoid: GCF 018919395 1
    • AAI clade 4-8 medoid: GCA 902528415 1
    • AAI clade 4-9 medoid: GCF 004152845 1
    • AAI clade 4-10 medoid: GCF 002858865 1
    • AAI clade 4-11 medoid: GCF 014204545 1
    • AAI clade 4-12 medoid: GCF 013035315 1
    • AAI clade 4-13 medoid: GCF 008932435 1
    • AAI clade 4-14 medoid: GCF 000262405 1
    • AAI clade 4-15 medoid: GCA 902595525 1
    • AAI clade 4-16 medoid: GCF 009696265 1
    • AAI clade 4-17 medoid: GCA 902793695 1
    • AAI clade 4-18 medoid: GCF 002215495 1
    • AAI clade 4-19 medoid: GCF 013170705 1
    • AAI clade 4-20 medoid: GCA 005503215 1
    • AAI clade 4-21 medoid: GCF 014358075 1
    • AAI clade 4-22 medoid: GCF 000743575 1
    • AAI clade 4-23 medoid: GCA 015062495 1
  • AAI clade 5 medoid: GCA 012798955 1
  • AAI clade 6 medoid: GCA 013415575 1
  • AAI clade 7 medoid: GCF 008638345 1
  • AAI clade 8 medoid: GCF 000807255 1
  • AAI clade 9 medoid: GCF 001050135 1
  • AAI clade 10 medoid: GCA 002717245 1
  • AAI clade 11 medoid: GCA 017478625 1
  • AAI clade 12 medoid: GCA 009773355 1
  • AAI clade 13 medoid: GCA 905200435 1
  • AAI clade 14 medoid: GCA 017516885 1
  • AAI clade 15 medoid: GCA 004321885 1
  • AAI clade 16 medoid: GCA 905236305 1
  • AAI clade 17 medoid: GCA 017648525 1
  • AAI clade 18 medoid: GCA 019113065 1
  • AAI clade 19 medoid: GCA 016795075 1
  • AAI clade 20 medoid: GCF 001467025 1
  • AAI clade 21 medoid: GCA 017642855 1
  • AAI clade 22 medoid: GCA 017408305 1
  • AAI clade 23 medoid: GCA 002436405 1