AAI-based medoid clustering

The AAI clusters provide a good overview of the above-species structure of the datasets and facilitate taxonomic classification.

  • AAI clade 1 medoid: GCA 017502845 1
  • AAI clade 2 medoid: GCA 002434265 1
  • AAI clade 3 medoid: GCA 013002175 1
    • AAI clade 3-1 medoid: GCF 014451325 1
    • AAI clade 3-2 medoid: GCF 000308435 1
    • AAI clade 3-3 medoid: GCF 002155905 1
    • AAI clade 3-4 medoid: GCF 012317045 1
    • AAI clade 3-5 medoid: GCF 003725545 1
      • AAI clade 3-5-1 medoid: GCF 015751785 1
      • AAI clade 3-5-2 medoid: GCF 003725545 1
        • AAI clade 3-5-2-1 medoid: GCF 003725545 1
          • AAI clade 3-5-2-1-1 medoid: GCF 003725545 1
            • AAI clade 3-5-2-1-1-1 medoid: GCF 014648395 1
            • AAI clade 3-5-2-1-1-2 medoid: GCF 900090295 1
              • AAI clade 3-5-2-1-1-2-1 medoid: GCF 014205165 1
              • AAI clade 3-5-2-1-1-2-2 medoid: GCA 016802835 1
              • AAI clade 3-5-2-1-1-2-3 medoid: GCA 016925615 1
              • AAI clade 3-5-2-1-1-2-4 medoid: GCF 000379825 1
              • AAI clade 3-5-2-1-1-2-5 medoid: GCF 000717135 1
              • AAI clade 3-5-2-1-1-2-6 medoid: GCF 001567585 1
              • AAI clade 3-5-2-1-1-2-7 medoid: GCF 017599305 1
              • AAI clade 3-5-2-1-1-2-8 medoid: GCF 002285795 1
              • AAI clade 3-5-2-1-1-2-9 medoid: GCF 003236335 1
              • AAI clade 3-5-2-1-1-2-10 medoid: GCF 003434305 1
              • AAI clade 3-5-2-1-1-2-11 medoid: GCF 003610785 1
              • AAI clade 3-5-2-1-1-2-12 medoid: GCF 003626595 1
              • AAI clade 3-5-2-1-1-2-13 medoid: GCF 004348525 1
              • AAI clade 3-5-2-1-1-2-14 medoid: GCF 003626655 1
              • AAI clade 3-5-2-1-1-2-15 medoid: GCF 003633685 1
              • AAI clade 3-5-2-1-1-2-16 medoid: GCF 900091445 1
              • AAI clade 3-5-2-1-1-2-17 medoid: GCF 004348595 1
              • AAI clade 3-5-2-1-1-2-18 medoid: GCF 007830265 1
              • AAI clade 3-5-2-1-1-2-19 medoid: GCF 009707425 1
              • AAI clade 3-5-2-1-1-2-20 medoid: GCF 011764545 1
              • AAI clade 3-5-2-1-1-2-21 medoid: GCF 014203835 1
              • AAI clade 3-5-2-1-1-2-22 medoid: GCF 016863655 1
              • AAI clade 3-5-2-1-1-2-23 medoid: GCF 017614955 1
              • AAI clade 3-5-2-1-1-2-24 medoid: GCF 900090295 1
              • AAI clade 3-5-2-1-1-2-25 medoid: GCF 900091555 1
              • AAI clade 3-5-2-1-1-2-26 medoid: GCF 900090325 1
              • AAI clade 3-5-2-1-1-2-27 medoid: GCF 900091495 1
              • AAI clade 3-5-2-1-1-2-28 medoid: GCF 900091425 1
              • AAI clade 3-5-2-1-1-2-29 medoid: GCF 900091515 1
              • AAI clade 3-5-2-1-1-2-30 medoid: GCF 900091585 1
              • AAI clade 3-5-2-1-1-2-31 medoid: GCF 900091615 1
              • AAI clade 3-5-2-1-1-2-32 medoid: GCF 900143005 1
          • AAI clade 3-5-2-1-2 medoid: GCF 016862915 1
          • AAI clade 3-5-2-1-3 medoid: GCF 007994225 1
          • AAI clade 3-5-2-1-4 medoid: GCF 900188485 1
        • AAI clade 3-5-2-2 medoid: GCF 018324685 1
      • AAI clade 3-5-3 medoid: GCF 015704865 1
      • AAI clade 3-5-4 medoid: GCA 003610235 1
      • AAI clade 3-5-5 medoid: GCF 016863495 1
      • AAI clade 3-5-6 medoid: GCF 000514815 1
      • AAI clade 3-5-7 medoid: GCF 003933745 1
    • AAI clade 3-6 medoid: GCF 001836165 1
    • AAI clade 3-7 medoid: GCF 000342005 1
    • AAI clade 3-8 medoid: GCF 000014565 1
    • AAI clade 3-9 medoid: GCF 018224615 1
    • AAI clade 3-10 medoid: GCF 001667735 1
    • AAI clade 3-11 medoid: GCF 006539945 1
    • AAI clade 3-12 medoid: GCF 018613675 1
    • AAI clade 3-13 medoid: GCF 001942045 1
    • AAI clade 3-14 medoid: GCF 900323885 1
    • AAI clade 3-15 medoid: GCA 018375675 1
    • AAI clade 3-16 medoid: GCA 013911515 1
    • AAI clade 3-17 medoid: GCA 902611225 1
    • AAI clade 3-18 medoid: GCF 002288185 1
    • AAI clade 3-19 medoid: GCA 902576605 1
    • AAI clade 3-20 medoid: GCF 014191495 1
    • AAI clade 3-21 medoid: GCF 900143215 1
    • AAI clade 3-22 medoid: GCF 014646815 1
    • AAI clade 3-23 medoid: GCA 900770865 1
    • AAI clade 3-24 medoid: GCF 014805525 1
    • AAI clade 3-25 medoid: GCA 003158855 1
    • AAI clade 3-26 medoid: GCA 013813955 1
    • AAI clade 3-27 medoid: GCF 000092985 1
    • AAI clade 3-28 medoid: GCF 008327685 1
    • AAI clade 3-29 medoid: GCF 001007995 1
    • AAI clade 3-30 medoid: GCF 001806325 1
  • AAI clade 4 medoid: GCA 900110395 1
  • AAI clade 5 medoid: GCA 012798955 1
  • AAI clade 6 medoid: GCA 013415575 1
  • AAI clade 7 medoid: GCF 008638345 1
  • AAI clade 8 medoid: GCF 000807255 1
  • AAI clade 9 medoid: GCF 001050135 1
  • AAI clade 10 medoid: GCA 002717245 1
  • AAI clade 11 medoid: GCA 017478625 1
  • AAI clade 12 medoid: GCA 009773355 1
  • AAI clade 13 medoid: GCA 905200435 1
  • AAI clade 14 medoid: GCA 017516885 1
  • AAI clade 15 medoid: GCA 004321885 1
  • AAI clade 16 medoid: GCA 905236305 1
  • AAI clade 17 medoid: GCA 017648525 1
  • AAI clade 18 medoid: GCA 019113065 1
  • AAI clade 19 medoid: GCA 016795075 1
  • AAI clade 20 medoid: GCF 001467025 1
  • AAI clade 21 medoid: GCA 017642855 1
  • AAI clade 22 medoid: GCA 017408305 1
  • AAI clade 23 medoid: GCA 002436405 1