AAI-based medoid clustering

The AAI clusters provide a good overview of the above-species structure of the datasets and facilitate taxonomic classification.

  • AAI clade 1 medoid: GCA 017502845 1
  • AAI clade 2 medoid: GCA 002434265 1
  • AAI clade 3 medoid: GCA 013002175 1
  • AAI clade 4 medoid: GCA 900110395 1
  • AAI clade 5 medoid: GCA 012798955 1
  • AAI clade 6 medoid: GCA 013415575 1
  • AAI clade 7 medoid: GCF 008638345 1
  • AAI clade 8 medoid: GCF 000807255 1
  • AAI clade 9 medoid: GCF 001050135 1
  • AAI clade 10 medoid: GCA 002717245 1
  • AAI clade 11 medoid: GCA 017478625 1
  • AAI clade 12 medoid: GCA 009773355 1
  • AAI clade 13 medoid: GCA 905200435 1
  • AAI clade 14 medoid: GCA 017516885 1
  • AAI clade 15 medoid: GCA 004321885 1
  • AAI clade 16 medoid: GCA 905236305 1
    • AAI clade 16-1 medoid: GCF 002161085 1
    • AAI clade 16-2 medoid: GCA 902791215 1
      • AAI clade 16-2-1 medoid: GCA 004558025 1
      • AAI clade 16-2-2 medoid: GCA 900317855 1
      • AAI clade 16-2-3 medoid: GCA 017515345 1
      • AAI clade 16-2-4 medoid: GCA 902791215 1
        • AAI clade 16-2-4-1 medoid: GCA 902791215 1
          • AAI clade 16-2-4-1-1 medoid: GCA 902791215 1
            • AAI clade 16-2-4-1-1-1 medoid: GCA 902791215 1
              • AAI clade 16-2-4-1-1-1-1 medoid: GCA 002315275 1
              • AAI clade 16-2-4-1-1-1-2 medoid: GCA 002431965 1
              • AAI clade 16-2-4-1-1-1-3 medoid: GCA 003150355 1
              • AAI clade 16-2-4-1-1-1-4 medoid: GCA 004560305 1
              • AAI clade 16-2-4-1-1-1-5 medoid: GCA 004562175 1
              • AAI clade 16-2-4-1-1-1-6 medoid: GCA 017465025 1
              • AAI clade 16-2-4-1-1-1-7 medoid: GCA 017406005 1
              • AAI clade 16-2-4-1-1-1-8 medoid: GCA 017410425 1
                1 dataset: GCA 017410425 1 (AAI: 100.0%)
              • AAI clade 16-2-4-1-1-1-9 medoid: GCA 017432685 1
              • AAI clade 16-2-4-1-1-1-10 medoid: GCA 017458085 1
              • AAI clade 16-2-4-1-1-1-11 medoid: GCA 017477695 1
              • AAI clade 16-2-4-1-1-1-12 medoid: GCA 017481225 1
              • AAI clade 16-2-4-1-1-1-13 medoid: GCA 017507985 1
              • AAI clade 16-2-4-1-1-1-14 medoid: GCA 017652685 1
              • AAI clade 16-2-4-1-1-1-15 medoid: GCA 017938835 1
              • AAI clade 16-2-4-1-1-1-16 medoid: GCA 017959745 1
              • AAI clade 16-2-4-1-1-1-17 medoid: GCA 018711755 1
              • AAI clade 16-2-4-1-1-1-18 medoid: GCA 900313925 1
              • AAI clade 16-2-4-1-1-1-19 medoid: GCA 900317375 1
              • AAI clade 16-2-4-1-1-1-20 medoid: GCA 900319275 1
              • AAI clade 16-2-4-1-1-1-21 medoid: GCA 902785905 1
              • AAI clade 16-2-4-1-1-1-22 medoid: GCA 900319835 1
              • AAI clade 16-2-4-1-1-1-23 medoid: GCA 900321275 1
              • AAI clade 16-2-4-1-1-1-24 medoid: GCA 900546515 1
              • AAI clade 16-2-4-1-1-1-25 medoid: GCA 900547315 1
              • AAI clade 16-2-4-1-1-1-26 medoid: GCA 900549485 1
              • AAI clade 16-2-4-1-1-1-27 medoid: GCA 900754515 1
              • AAI clade 16-2-4-1-1-1-28 medoid: GCA 902790375 1
              • AAI clade 16-2-4-1-1-1-29 medoid: GCA 902775735 1
              • AAI clade 16-2-4-1-1-1-30 medoid: GCA 902778665 1
              • AAI clade 16-2-4-1-1-1-31 medoid: GCA 902779945 1
              • AAI clade 16-2-4-1-1-1-32 medoid: GCA 902791215 1
              • AAI clade 16-2-4-1-1-1-33 medoid: GCA 902793285 1
              • AAI clade 16-2-4-1-1-1-34 medoid: GCA 902802215 1
            • AAI clade 16-2-4-1-1-2 medoid: GCA 017542425 1
          • AAI clade 16-2-4-1-2 medoid: GCA 902802045 1
        • AAI clade 16-2-4-2 medoid: GCA 900316205 1
      • AAI clade 16-2-5 medoid: GCA 900545405 1
    • AAI clade 16-3 medoid: GCA 000432135 1
    • AAI clade 16-4 medoid: GCA 018712645 1
    • AAI clade 16-5 medoid: GCA 900551355 1
    • AAI clade 16-6 medoid: GCA 910587705 1
    • AAI clade 16-7 medoid: GCA 902767845 1
    • AAI clade 16-8 medoid: GCA 014799505 1
    • AAI clade 16-9 medoid: GCA 910588045 1
  • AAI clade 17 medoid: GCA 017648525 1
  • AAI clade 18 medoid: GCA 019113065 1
  • AAI clade 19 medoid: GCA 016795075 1
  • AAI clade 20 medoid: GCF 001467025 1
  • AAI clade 21 medoid: GCA 017642855 1
  • AAI clade 22 medoid: GCA 017408305 1
  • AAI clade 23 medoid: GCA 002436405 1