AAI-based medoid clustering
The AAI clusters provide a good overview of the above-species structure of the datasets and facilitate taxonomic classification.
-
AAI clade 1
medoid: GCA 017502845 1
-
AAI clade 2
medoid: GCA 002434265 1
-
AAI clade 3
medoid: GCA 013002175 1
-
AAI clade 4
medoid: GCA 900110395 1
-
AAI clade 5
medoid: GCA 012798955 1
-
AAI clade 6
medoid: GCA 013415575 1
-
AAI clade 7
medoid: GCF 008638345 1
-
AAI clade 8
medoid: GCF 000807255 1
-
AAI clade 9
medoid: GCF 001050135 1
-
AAI clade 10
medoid: GCA 002717245 1
-
AAI clade 11
medoid: GCA 017478625 1
-
AAI clade 11-1
medoid: GCA 017447265 1
-
AAI clade 11-2
medoid: GCA 014801985 1
-
AAI clade 11-3
medoid: GCA 902362375 1
-
AAI clade 11-4
medoid: GCF 002224675 1
-
AAI clade 11-5
medoid: GCF 000519105 1
-
AAI clade 11-6
medoid: GCF 000154105 1
-
AAI clade 11-7
medoid: GCA 018054805 1
-
AAI clade 11-8
medoid: GCA 900544195 1
-
AAI clade 11-9
medoid: GCA 014801735 1
-
AAI clade 11-10
medoid: GCA 017449675 1
-
AAI clade 11-10-1
medoid: GCF 900106785 1
-
AAI clade 11-10-2
medoid: GCA 017449675 1
-
AAI clade 11-10-2-1
medoid: GCA 902792635 1
-
AAI clade 11-10-2-2
medoid: GCA 905214625 1
-
AAI clade 11-10-2-3
medoid: GCA 017940005 1
-
AAI clade 11-10-2-4
medoid: GCA 017449675 1
-
AAI clade 11-10-2-4-1
medoid: GCA 017449675 1
-
AAI clade 11-10-2-4-1-1
medoid: GCA 017449675 1
-
AAI clade 11-10-2-4-1-1-1
medoid: GCA 017449675 1
-
AAI clade 11-10-2-4-1-1-1-1
medoid: GCA 017449675 1
-
AAI clade 11-10-2-4-1-1-1-1-1
medoid: GCA 017449675 1
-
AAI clade 11-10-2-4-1-1-1-1-1-1
medoid: GCA 017449675 1
-
AAI clade 11-10-2-4-1-1-1-1-1-1-1
medoid: GCA 017449675 1
-
AAI clade 11-10-2-4-1-1-1-1-1-1-1-1
medoid: GCA 017449675 1
-
AAI clade 11-10-2-4-1-1-1-1-1-1-1-1-1
medoid: GCA 017449675 1
-
AAI clade 11-10-2-4-1-1-1-1-1-1-1-1-2
medoid: GCA 002315795 1
-
AAI clade 11-10-2-4-1-1-1-1-1-1-1-1-3
medoid: GCA 002317115 1
-
AAI clade 11-10-2-4-1-1-1-1-1-1-1-1-4
medoid: GCA 905235835 1
-
AAI clade 11-10-2-4-1-1-1-1-1-1-1-1-5
medoid: GCA 002362105 1
-
AAI clade 11-10-2-4-1-1-1-1-1-1-1-1-6
medoid: GCA 002480935 1
-
AAI clade 11-10-2-4-1-1-1-1-1-1-1-1-7
medoid: GCA 011524845 1
-
AAI clade 11-10-2-4-1-1-1-1-1-1-1-1-8
medoid: GCA 902768105 1
6 datasets: GCA 017423565 1 (AAI: 67.97%), GCA 017467705 1 (AAI: 66.0%), GCA 017940545 1 (AAI: 67.24%), GCA 900320255 1 (AAI: 68.15%), GCA 902768105 1 (AAI: 100.0%), and GCA 905236875 1 (AAI: 67.43%)
-
AAI clade 11-10-2-4-1-1-1-1-1-1-1-1-9
medoid: GCA 017428925 1
-
AAI clade 11-10-2-4-1-1-1-1-1-1-1-1-10
medoid: GCA 902783885 1
-
AAI clade 11-10-2-4-1-1-1-1-1-1-1-1-11
medoid: GCA 017449725 1
-
AAI clade 11-10-2-4-1-1-1-1-1-1-1-1-12
medoid: GCA 017468985 1
-
AAI clade 11-10-2-4-1-1-1-1-1-1-1-1-13
medoid: GCA 017616915 1
-
AAI clade 11-10-2-4-1-1-1-1-1-1-1-1-14
medoid: GCA 017627765 1
-
AAI clade 11-10-2-4-1-1-1-1-1-1-1-1-15
medoid: GCA 017940185 1
-
AAI clade 11-10-2-4-1-1-1-1-1-1-1-1-16
medoid: GCA 017959365 1
-
AAI clade 11-10-2-4-1-1-1-1-1-1-1-1-17
medoid: GCA 018065415 1
-
AAI clade 11-10-2-4-1-1-1-1-1-1-1-1-18
medoid: GCA 018883665 1
-
AAI clade 11-10-2-4-1-1-1-1-1-1-1-1-19
medoid: GCA 902776605 1
-
AAI clade 11-10-2-4-1-1-1-1-1-1-1-1-20
medoid: GCA 902783625 1
-
AAI clade 11-10-2-4-1-1-1-1-1-1-1-1-21
medoid: GCA 905234815 1
-
AAI clade 11-10-2-4-1-1-1-1-1-1-1-1-22
medoid: GCA 905236195 1
-
AAI clade 11-10-2-4-1-1-1-1-1-1-1-1-23
medoid: GCA 905372445 1
-
AAI clade 11-10-2-4-1-1-1-1-1-1-1-1-24
medoid: GCF 000022605 2
-
AAI clade 11-10-2-4-1-1-1-1-1-1-1-1-25
medoid: GCF 003043945 1
-
AAI clade 11-10-2-4-1-1-1-1-1-1-1-1-1
medoid: GCA 017449675 1
-
AAI clade 11-10-2-4-1-1-1-1-1-1-1-2
medoid: GCA 016291595 1
-
AAI clade 11-10-2-4-1-1-1-1-1-1-1-3
medoid: GCA 017442825 1
-
AAI clade 11-10-2-4-1-1-1-1-1-1-1-1
medoid: GCA 017449675 1
-
AAI clade 11-10-2-4-1-1-1-1-1-1-2
medoid: GCA 012798265 1
-
AAI clade 11-10-2-4-1-1-1-1-1-1-1
medoid: GCA 017449675 1
-
AAI clade 11-10-2-4-1-1-1-1-1-2
medoid: GCA 016710285 1
-
AAI clade 11-10-2-4-1-1-1-1-1-1
medoid: GCA 017449675 1
-
AAI clade 11-10-2-4-1-1-1-1-2
medoid: GCA 017964465 1
-
AAI clade 11-10-2-4-1-1-1-1-1
medoid: GCA 017449675 1
-
AAI clade 11-10-2-4-1-1-1-2
medoid: GCA 900318305 1
-
AAI clade 11-10-2-4-1-1-1-1
medoid: GCA 017449675 1
-
AAI clade 11-10-2-4-1-1-2
medoid: GCA 017617315 1
-
AAI clade 11-10-2-4-1-1-1
medoid: GCA 017449675 1
-
AAI clade 11-10-2-4-1-2
medoid: GCA 902581045 1
-
AAI clade 11-10-2-4-1-1
medoid: GCA 017449675 1
-
AAI clade 11-10-2-4-2
medoid: GCA 002437495 1
-
AAI clade 11-10-2-4-1
medoid: GCA 017449675 1
-
AAI clade 11-10-2-5
medoid: GCA 900544495 1
-
AAI clade 11-10-2-6
medoid: GCA 902801155 1
-
AAI clade 11-10-2-7
medoid: GCA 017557635 1
-
AAI clade 11-10-2-8
medoid: GCA 902799355 1
-
AAI clade 11-10-2-9
medoid: GCA 016287755 1
-
AAI clade 11-10-2-10
medoid: GCA 017642485 1
-
AAI clade 11-10-2-11
medoid: GCA 900318885 1
-
AAI clade 11-10-2-12
medoid: GCA 902775475 1
-
AAI clade 11-10-2-13
medoid: GCA 900315095 1
-
AAI clade 11-10-2-14
medoid: GCA 905233165 1
-
AAI clade 11-10-2-15
medoid: GCA 900316285 1
-
AAI clade 11-10-2-16
medoid: GCF 001953955 1
-
AAI clade 11-10-2-17
medoid: GCF 013166595 1
-
AAI clade 11-10-2-18
medoid: GCA 017617615 1
-
AAI clade 11-10-2-19
medoid: GCA 017483185 1
-
AAI clade 11-10-2-20
medoid: GCF 900100635 1
-
AAI clade 11-10-2-21
medoid: GCF 000177075 1
-
AAI clade 11-10-2-22
medoid: GCF 000378085 1
-
AAI clade 11-10-2-1
medoid: GCA 902792635 1
-
AAI clade 11-10-1
medoid: GCF 900106785 1
-
AAI clade 11-11
medoid: GCA 017477245 1
-
AAI clade 11-12
medoid: GCA 900541585 1
-
AAI clade 11-13
medoid: GCA 016715075 1
-
AAI clade 11-14
medoid: GCA 002372855 1
-
AAI clade 11-15
medoid: GCA 900317055 1
-
AAI clade 11-16
medoid: GCA 902791865 1
-
AAI clade 11-17
medoid: GCA 902774295 1
-
AAI clade 11-18
medoid: GCA 903945175 1
-
AAI clade 11-19
medoid: GCF 003712195 1
-
AAI clade 11-20
medoid: GCA 902801475 1
-
AAI clade 11-21
medoid: GCA 017438945 1
-
AAI clade 11-22
medoid: GCA 017961145 1
-
AAI clade 11-23
medoid: GCA 015060255 1
-
AAI clade 11-24
medoid: GCA 017394705 1
-
AAI clade 11-25
medoid: GCA 017405965 1
-
AAI clade 11-26
medoid: GCF 000025925 1
-
AAI clade 11-27
medoid: GCA 016286385 1
-
AAI clade 11-28
medoid: GCA 017465575 1
-
AAI clade 11-1
medoid: GCA 017447265 1
-
AAI clade 12
medoid: GCA 009773355 1
-
AAI clade 13
medoid: GCA 905200435 1
-
AAI clade 14
medoid: GCA 017516885 1
-
AAI clade 15
medoid: GCA 004321885 1
-
AAI clade 16
medoid: GCA 905236305 1
-
AAI clade 17
medoid: GCA 017648525 1
-
AAI clade 18
medoid: GCA 019113065 1
-
AAI clade 19
medoid: GCA 016795075 1
-
AAI clade 20
medoid: GCF 001467025 1
-
AAI clade 21
medoid: GCA 017642855 1
-
AAI clade 22
medoid: GCA 017408305 1
-
AAI clade 23
medoid: GCA 002436405 1