AAI-based medoid clustering

The AAI clusters provide a good overview of the above-species structure of the datasets and facilitate taxonomic classification.

• AAI clade 1 medoid: GCA 017502845 1
• AAI clade 2 medoid: GCA 002434265 1
• AAI clade 3 medoid: GCA 013002175 1
• AAI clade 4 medoid: GCA 900110395 1
• AAI clade 5 medoid: GCA 012798955 1
• AAI clade 6 medoid: GCA 013415575 1
• AAI clade 7 medoid: GCF 008638345 1
• AAI clade 8 medoid: GCF 000807255 1
• AAI clade 9 medoid: GCF 001050135 1
• AAI clade 10 medoid: GCA 002717245 1
  • AAI clade 10-1 medoid: GCA 902595625 1
  • AAI clade 10-2 medoid: GCA 902602135 1
  • AAI clade 10-3 medoid: GCA 902597515 1
  • AAI clade 10-4 medoid: GCA 902568425 1
  • AAI clade 10-5 medoid: GCA 902624345 1
  • AAI clade 10-6 medoid: GCA 902589395 1
  • AAI clade 10-7 medoid: GCA 902541515 1
  • AAI clade 10-8 medoid: GCA 902535625 1
    • AAI clade 10-8-1 medoid: GCA 902586025 1
      • AAI clade 10-8-1-1 medoid: GCA 902586025 1
        • AAI clade 10-8-1-1-1 medoid: GCA 902586025 1
          • AAI clade 10-8-1-1-1-1 medoid: GCA 902586025 1
            • AAI clade 10-8-1-1-1-1-1 medoid: GCA 902586025 1
              • AAI clade 10-8-1-1-1-1-1-1 medoid: GCA 001704065 1
              • AAI clade 10-8-1-1-1-1-1-2 medoid: GCA 902521355 1
              • AAI clade 10-8-1-1-1-1-1-3 medoid: GCA 902537055 1
              • AAI clade 10-8-1-1-1-1-1-4 medoid: GCA 902542235 1
              • AAI clade 10-8-1-1-1-1-1-5 medoid: GCA 902586025 1
              • AAI clade 10-8-1-1-1-1-1-6 medoid: GCA 902543575 1
              • AAI clade 10-8-1-1-1-1-1-7 medoid: GCA 902545405 1
                1 dataset: GCA 902545405 1 (AAI: 100.0%)
              • AAI clade 10-8-1-1-1-1-1-8 medoid: GCA 902570695 1
              • AAI clade 10-8-1-1-1-1-1-9 medoid: GCA 902574685 1
              • AAI clade 10-8-1-1-1-1-1-10 medoid: GCA 902576115 1
              • AAI clade 10-8-1-1-1-1-1-11 medoid: GCA 902576785 1
              • AAI clade 10-8-1-1-1-1-1-12 medoid: GCA 902580505 1
              • AAI clade 10-8-1-1-1-1-1-13 medoid: GCA 902588975 1
              • AAI clade 10-8-1-1-1-1-1-14 medoid: GCA 902592965 1
              • AAI clade 10-8-1-1-1-1-1-15 medoid: GCA 902595815 1
              • AAI clade 10-8-1-1-1-1-1-16 medoid: GCA 902598655 1
              • AAI clade 10-8-1-1-1-1-1-17 medoid: GCA 902599485 1
              • AAI clade 10-8-1-1-1-1-1-18 medoid: GCA 902609705 1
              • AAI clade 10-8-1-1-1-1-1-19 medoid: GCA 902616245 1
            • AAI clade 10-8-1-1-1-1-2 medoid: GCA 902541285 1
          • AAI clade 10-8-1-1-1-2 medoid: GCA 902524595 1
          • AAI clade 10-8-1-1-1-3 medoid: GCA 902524995 1
          • AAI clade 10-8-1-1-1-4 medoid: GCA 902539195 1
          • AAI clade 10-8-1-1-1-5 medoid: GCA 902577875 1
          • AAI clade 10-8-1-1-1-6 medoid: GCA 902613065 1
          • AAI clade 10-8-1-1-1-7 medoid: GCA 902622245 1
          • AAI clade 10-8-1-1-1-8 medoid: GCA 902624535 1
        • AAI clade 10-8-1-1-2 medoid: GCA 902630065 1
      • AAI clade 10-8-1-2 medoid: GCA 003211555 1
    • AAI clade 10-8-2 medoid: GCA 902535625 1
    • AAI clade 10-8-3 medoid: GCA 902531025 1
    • AAI clade 10-8-4 medoid: GCF 002101295 1
    • AAI clade 10-8-5 medoid: GCA 902522225 1
    • AAI clade 10-8-6 medoid: GCA 902595115 1
    • AAI clade 10-8-7 medoid: GCA 902607115 1
  • AAI clade 10-9 medoid: GCA 902533965 1
  • AAI clade 10-10 medoid: GCA 902604225 1
  • AAI clade 10-11 medoid: GCA 902599045 1
  • AAI clade 10-12 medoid: GCA 902622795 1
  • AAI clade 10-13 medoid: GCA 902546375 1
• AAI clade 11 medoid: GCA 017478625 1
• AAI clade 12 medoid: GCA 009773355 1
• AAI clade 13 medoid: GCA 905200435 1
• AAI clade 14 medoid: GCA 017516885 1
• AAI clade 15 medoid: GCA 004321885 1
• AAI clade 16 medoid: GCA 905236305 1
• AAI clade 17 medoid: GCA 017648525 1
• AAI clade 18 medoid: GCA 019113065 1
• AAI clade 19 medoid: GCA 016795075 1
• AAI clade 20 medoid: GCF 001467025 1
• AAI clade 21 medoid: GCA 017642855 1
• AAI clade 22 medoid: GCA 017408305 1
• AAI clade 23 medoid: GCA 002436405 1