AAI-based medoid clustering

The AAI clusters provide a good overview of the above-species structure of the datasets and facilitate taxonomic classification.

  • AAI clade 1 medoid: GCA 017502845 1
  • AAI clade 2 medoid: GCA 002434265 1
  • AAI clade 3 medoid: GCA 013002175 1
  • AAI clade 4 medoid: GCA 900110395 1
  • AAI clade 5 medoid: GCA 012798955 1
  • AAI clade 6 medoid: GCA 013415575 1
  • AAI clade 7 medoid: GCF 008638345 1
  • AAI clade 8 medoid: GCF 000807255 1
  • AAI clade 9 medoid: GCF 001050135 1
  • AAI clade 10 medoid: GCA 002717245 1
    • AAI clade 10-1 medoid: GCA 902595625 1
    • AAI clade 10-2 medoid: GCA 902602135 1
    • AAI clade 10-3 medoid: GCA 902597515 1
      • AAI clade 10-3-1 medoid: GCA 902597515 1
        • AAI clade 10-3-1-1 medoid: GCA 902597515 1
          • AAI clade 10-3-1-1-1 medoid: GCA 902597515 1
            • AAI clade 10-3-1-1-1-1 medoid: GCA 902597515 1
              • AAI clade 10-3-1-1-1-1-1 medoid: GCA 902597515 1
                • AAI clade 10-3-1-1-1-1-1-1 medoid: GCA 000299095 1
                • AAI clade 10-3-1-1-1-1-1-2 medoid: GCA 902597515 1
                  • AAI clade 10-3-1-1-1-1-1-2-1 medoid: GCA 002169475 2
                  • AAI clade 10-3-1-1-1-1-1-2-2 medoid: GCA 902597515 1
                    • AAI clade 10-3-1-1-1-1-1-2-2-1 medoid: GCA 902597515 1
                      • AAI clade 10-3-1-1-1-1-1-2-2-1-1 medoid: GCA 902597515 1
                        • AAI clade 10-3-1-1-1-1-1-2-2-1-1-1 medoid: GCA 902597515 1
                          • AAI clade 10-3-1-1-1-1-1-2-2-1-1-1-1 medoid: GCA 902597515 1
                            • AAI clade 10-3-1-1-1-1-1-2-2-1-1-1-1-1 medoid: GCA 902597515 1
                              • AAI clade 10-3-1-1-1-1-1-2-2-1-1-1-1-1-1 medoid: GCA 902597515 1
                                • AAI clade 10-3-1-1-1-1-1-2-2-1-1-1-1-1-1-1 medoid: GCA 902597515 1
                                  • AAI clade 10-3-1-1-1-1-1-2-2-1-1-1-1-1-1-1-1 medoid: GCA 003213615 1
                                  • AAI clade 10-3-1-1-1-1-1-2-2-1-1-1-1-1-1-1-2 medoid: GCA 003279775 1
                                  • AAI clade 10-3-1-1-1-1-1-2-2-1-1-1-1-1-1-1-3 medoid: GCA 003281005 1
                                  • AAI clade 10-3-1-1-1-1-1-2-2-1-1-1-1-1-1-1-4 medoid: GCA 902522385 1
                                  • AAI clade 10-3-1-1-1-1-1-2-2-1-1-1-1-1-1-1-5 medoid: GCA 902523515 1
                                  • AAI clade 10-3-1-1-1-1-1-2-2-1-1-1-1-1-1-1-6 medoid: GCA 902527415 1
                                  • AAI clade 10-3-1-1-1-1-1-2-2-1-1-1-1-1-1-1-7 medoid: GCA 902532645 1
                                  • AAI clade 10-3-1-1-1-1-1-2-2-1-1-1-1-1-1-1-8 medoid: GCA 902541745 1
                                  • AAI clade 10-3-1-1-1-1-1-2-2-1-1-1-1-1-1-1-9 medoid: GCA 902542855 1
                                  • AAI clade 10-3-1-1-1-1-1-2-2-1-1-1-1-1-1-1-10 medoid: GCA 902545555 1
                                  • AAI clade 10-3-1-1-1-1-1-2-2-1-1-1-1-1-1-1-11 medoid: GCA 902557995 1
                                  • AAI clade 10-3-1-1-1-1-1-2-2-1-1-1-1-1-1-1-12 medoid: GCA 902566705 1
                                  • AAI clade 10-3-1-1-1-1-1-2-2-1-1-1-1-1-1-1-13 medoid: GCA 902578325 1
                                  • AAI clade 10-3-1-1-1-1-1-2-2-1-1-1-1-1-1-1-14 medoid: GCA 902588315 1
                                  • AAI clade 10-3-1-1-1-1-1-2-2-1-1-1-1-1-1-1-15 medoid: GCA 902589725 1
                                  • AAI clade 10-3-1-1-1-1-1-2-2-1-1-1-1-1-1-1-16 medoid: GCA 902592375 1
                                  • AAI clade 10-3-1-1-1-1-1-2-2-1-1-1-1-1-1-1-17 medoid: GCA 902593235 1
                                  • AAI clade 10-3-1-1-1-1-1-2-2-1-1-1-1-1-1-1-18 medoid: GCA 902595285 1
                                  • AAI clade 10-3-1-1-1-1-1-2-2-1-1-1-1-1-1-1-19 medoid: GCA 902596375 1
                                  • AAI clade 10-3-1-1-1-1-1-2-2-1-1-1-1-1-1-1-20 medoid: GCF 001180025 1
                                  • AAI clade 10-3-1-1-1-1-1-2-2-1-1-1-1-1-1-1-21 medoid: GCA 902599335 1
                                  • AAI clade 10-3-1-1-1-1-1-2-2-1-1-1-1-1-1-1-22 medoid: GCA 902604035 1
                                  • AAI clade 10-3-1-1-1-1-1-2-2-1-1-1-1-1-1-1-23 medoid: GCA 902604545 1
                                  • AAI clade 10-3-1-1-1-1-1-2-2-1-1-1-1-1-1-1-24 medoid: GCA 902617805 1
                                  • AAI clade 10-3-1-1-1-1-1-2-2-1-1-1-1-1-1-1-25 medoid: GCA 902623415 1
                                  • AAI clade 10-3-1-1-1-1-1-2-2-1-1-1-1-1-1-1-26 medoid: GCA 902624015 1
                                  • AAI clade 10-3-1-1-1-1-1-2-2-1-1-1-1-1-1-1-27 medoid: GCA 902633985 1
                                  • AAI clade 10-3-1-1-1-1-1-2-2-1-1-1-1-1-1-1-28 medoid: GCA 902635665 1
                                  • AAI clade 10-3-1-1-1-1-1-2-2-1-1-1-1-1-1-1-29 medoid: GCA 902635865 1
                                  • AAI clade 10-3-1-1-1-1-1-2-2-1-1-1-1-1-1-1-30 medoid: GCF 001180165 1
                                  • AAI clade 10-3-1-1-1-1-1-2-2-1-1-1-1-1-1-1-31 medoid: GCF 001180205 1
                                  • AAI clade 10-3-1-1-1-1-1-2-2-1-1-1-1-1-1-1-32 medoid: GCF 007833635 1
                                • AAI clade 10-3-1-1-1-1-1-2-2-1-1-1-1-1-1-2 medoid: GCA 902525565 1
                                • AAI clade 10-3-1-1-1-1-1-2-2-1-1-1-1-1-1-3 medoid: GCA 902553675 1
                                • AAI clade 10-3-1-1-1-1-1-2-2-1-1-1-1-1-1-4 medoid: GCA 902609235 1
                              • AAI clade 10-3-1-1-1-1-1-2-2-1-1-1-1-1-2 medoid: GCA 902587755 1
                            • AAI clade 10-3-1-1-1-1-1-2-2-1-1-1-1-2 medoid: GCA 902517615 1
                            • AAI clade 10-3-1-1-1-1-1-2-2-1-1-1-1-3 medoid: GCA 902529645 1
                            • AAI clade 10-3-1-1-1-1-1-2-2-1-1-1-1-4 medoid: GCA 902555535 1
                            • AAI clade 10-3-1-1-1-1-1-2-2-1-1-1-1-5 medoid: GCA 902559075 1
                            • AAI clade 10-3-1-1-1-1-1-2-2-1-1-1-1-6 medoid: GCA 902591845 1
                            • AAI clade 10-3-1-1-1-1-1-2-2-1-1-1-1-7 medoid: GCA 902595795 1
                            • AAI clade 10-3-1-1-1-1-1-2-2-1-1-1-1-8 medoid: GCA 902600245 1
                            • AAI clade 10-3-1-1-1-1-1-2-2-1-1-1-1-9 medoid: GCA 902624045 1
                            • AAI clade 10-3-1-1-1-1-1-2-2-1-1-1-1-10 medoid: GCA 902628965 1
                            • AAI clade 10-3-1-1-1-1-1-2-2-1-1-1-1-11 medoid: GCA 902632545 1
                          • AAI clade 10-3-1-1-1-1-1-2-2-1-1-1-2 medoid: GCA 902600855 1
                        • AAI clade 10-3-1-1-1-1-1-2-2-1-1-2 medoid: GCA 902628525 1
                      • AAI clade 10-3-1-1-1-1-1-2-2-1-2 medoid: GCA 902522895 1
                      • AAI clade 10-3-1-1-1-1-1-2-2-1-3 medoid: GCA 902522915 1
                      • AAI clade 10-3-1-1-1-1-1-2-2-1-4 medoid: GCA 902579105 1
                    • AAI clade 10-3-1-1-1-1-1-2-2-2 medoid: GCA 014654245 1
                • AAI clade 10-3-1-1-1-1-1-3 medoid: GCA 902594865 1
                • AAI clade 10-3-1-1-1-1-1-4 medoid: GCA 902526645 1
                • AAI clade 10-3-1-1-1-1-1-5 medoid: GCA 905616465 1
              • AAI clade 10-3-1-1-1-1-2 medoid: GCA 016870175 1
              • AAI clade 10-3-1-1-1-1-3 medoid: GCA 902552035 1
              • AAI clade 10-3-1-1-1-1-4 medoid: GCF 000008385 1
            • AAI clade 10-3-1-1-1-2 medoid: GCA 002701865 2
          • AAI clade 10-3-1-1-2 medoid: GCA 902595745 1
        • AAI clade 10-3-1-2 medoid: GCA 902559395 1
        • AAI clade 10-3-1-3 medoid: GCF 000012345 1
      • AAI clade 10-3-2 medoid: GCF 001180225 1
    • AAI clade 10-4 medoid: GCA 902568425 1
    • AAI clade 10-5 medoid: GCA 902624345 1
    • AAI clade 10-6 medoid: GCA 902589395 1
    • AAI clade 10-7 medoid: GCA 902541515 1
    • AAI clade 10-8 medoid: GCA 902535625 1
    • AAI clade 10-9 medoid: GCA 902533965 1
    • AAI clade 10-10 medoid: GCA 902604225 1
    • AAI clade 10-11 medoid: GCA 902599045 1
    • AAI clade 10-12 medoid: GCA 902622795 1
    • AAI clade 10-13 medoid: GCA 902546375 1
  • AAI clade 11 medoid: GCA 017478625 1
  • AAI clade 12 medoid: GCA 009773355 1
  • AAI clade 13 medoid: GCA 905200435 1
  • AAI clade 14 medoid: GCA 017516885 1
  • AAI clade 15 medoid: GCA 004321885 1
  • AAI clade 16 medoid: GCA 905236305 1
  • AAI clade 17 medoid: GCA 017648525 1
  • AAI clade 18 medoid: GCA 019113065 1
  • AAI clade 19 medoid: GCA 016795075 1
  • AAI clade 20 medoid: GCF 001467025 1
  • AAI clade 21 medoid: GCA 017642855 1
  • AAI clade 22 medoid: GCA 017408305 1
  • AAI clade 23 medoid: GCA 002436405 1