AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-47

AAI-based medoid clustering

The AAI clusters provide a good overview of the above-species structure of the datasets and facilitate taxonomic classification.

AAI clade 1 medoid: GCA 017502845 1
- AAI clade 1-1 medoid: GCA 900546775 1
  - AAI clade 1-1-1 medoid: GCF 010509075 1
    
    AAI clade 1-1-1-1 medoid: GCF 010509075 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-1 medoid: GCA 900546775 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2 medoid: GCA 900554645 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1 medoid: GCA 900554645 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1 medoid: GCA 900554645 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1 medoid: GCA 900554645 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1 medoid: GCA 900554645 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1 medoid: GCA 900554645 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1 medoid: GCA 900554645 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1 medoid: GCA 900554645 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1 medoid: GCA 900554645 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1 medoid: GCA 900554645 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1 medoid: GCA 900554645 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1 medoid: GCA 900541855 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2 medoid: GCA 900554645 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-1 medoid: GCA 900541145 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-2 medoid: GCA 905213265 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-3 medoid: GCA 000434535 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-4 medoid: GCA 014871605 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-5 medoid: GCA 018376905 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-6 medoid: GCA 018378775 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-7 medoid: GCA 018382295 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-8 medoid: GCA 900540935 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-9 medoid: GCA 900541015 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-10 medoid: GCA 900541025 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-11 medoid: GCA 900541035 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-12 medoid: GCA 900541285 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-13 medoid: GCA 900541675 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-14 medoid: GCA 900541725 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-15 medoid: GCA 900541875 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-16 medoid: GCA 900541885 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-17 medoid: GCA 900542125 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-18 medoid: GCA 900542315 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-19 medoid: GCA 900542905 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-20 medoid: GCA 900543025 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-21 medoid: GCA 900543615 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-22 medoid: GCA 900544065 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-23 medoid: GCA 900544095 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-24 medoid: GCA 900544135 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-25 medoid: GCA 900544235 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-26 medoid: GCA 900544845 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-27 medoid: GCA 900544875 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-28 medoid: GCA 900544995 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-29 medoid: GCA 900545055 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-30 medoid: GCA 900545165 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-31 medoid: GCA 900545615 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-32 medoid: GCA 900545745 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-33 medoid: GCA 900545905 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-34 medoid: GCA 900546455 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-35 medoid: GCA 900548565 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-36 medoid: GCA 900549245 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-37 medoid: GCA 900550785 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-38 medoid: GCA 900551655 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-39 medoid: GCA 900554255 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-40 medoid: GCA 900554495 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-41 medoid: GCA 900760245 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-42 medoid: GCA 900555745 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-43 medoid: GCA 900754385 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-44 medoid: GCA 900754445 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-45 medoid: GCA 900757235 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-46 medoid: GCA 900757505 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-47 medoid: GCA 900758845 1
    
    1 dataset: GCA 900758845 1 (AAI: 100.0%)
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-48 medoid: GCA 900760905 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-49 medoid: GCA 900761945 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-50 medoid: GCA 900767675 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-51 medoid: GCA 902362275 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-52 medoid: GCA 902363125 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-53 medoid: GCA 905199225 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-54 medoid: GCA 905214425 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-55 medoid: GCA 905215115 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-56 medoid: GCA 905216145 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-57 medoid: GCF 000763055 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-58 medoid: GCF 003438495 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-59 medoid: GCF 003458415 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-60 medoid: GCF 005845035 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-61 medoid: GCF 015552075 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-62 medoid: GCF 015553355 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-63 medoid: GCF 015555045 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2-64 medoid: GCF 015557435 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-3 medoid: GCA 008671285 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-4 medoid: GCA 900550205 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-5 medoid: GCA 900552425 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-6 medoid: GCA 900552755 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-2 medoid: GCA 900541785 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-3 medoid: GCA 900550355 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-1-4 medoid: GCA 900553165 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-1-2 medoid: GCA 900552295 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-1-2 medoid: GCA 900556515 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-1-2 medoid: GCF 009696325 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-2 medoid: GCA 900549335 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-3 medoid: GCA 900553215 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-1-4 medoid: GCA 900752475 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-1-2 medoid: GCA 900764025 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-2 medoid: GCA 900553935 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-3 medoid: GCA 900555225 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-1-4 medoid: GCA 900555815 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-2 medoid: GCA 900758375 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-3 medoid: GCA 900554985 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-1-4 medoid: GCA 900752345 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-1-2 medoid: GCA 900556705 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-2 medoid: GCA 900768795 1
    
    AAI clade 1-1-1-1-2-3 medoid: GCF 900155365 1
    
    AAI clade 1-1-1-2 medoid: GCF 002159765 1
  - AAI clade 1-1-2 medoid: GCF 012027725 1
  - AAI clade 1-1-3 medoid: GCA 900551665 1
  - AAI clade 1-1-4 medoid: GCA 015258605 1
- AAI clade 1-2 medoid: GCA 905221215 1
- AAI clade 1-3 medoid: GCF 015326965 1
- AAI clade 1-4 medoid: GCF 900094905 1
- AAI clade 1-5 medoid: GCF 008764295 1
- AAI clade 1-6 medoid: GCA 900551895 1
- AAI clade 1-7 medoid: GCF 009193305 1
- AAI clade 1-8 medoid: GCA 017503135 1
- AAI clade 1-9 medoid: GCA 900552565 1
- AAI clade 1-10 medoid: GCA 017411305 1
- AAI clade 1-11 medoid: GCF 001465345 1
- AAI clade 1-12 medoid: GCA 900759455 1
- AAI clade 1-13 medoid: GCF 015207245 1
- AAI clade 1-14 medoid: GCA 017960805 1
- AAI clade 1-15 medoid: GCA 001604115 1
- AAI clade 1-16 medoid: GCA 900551775 1
- AAI clade 1-17 medoid: GCA 016929555 1
- AAI clade 1-18 medoid: GCF 004770145 1
- AAI clade 1-19 medoid: GCF 004745505 1
- AAI clade 1-20 medoid: GCA 900761225 1
- AAI clade 1-21 medoid: GCA 900556695 1
- AAI clade 1-22 medoid: GCA 017504995 1
- AAI clade 1-23 medoid: GCA 900550055 1
- AAI clade 1-24 medoid: GCA 017464135 1
- AAI clade 1-25 medoid: GCA 014860805 1
AAI clade 2 medoid: GCA 002434265 1
AAI clade 3 medoid: GCA 013002175 1
AAI clade 4 medoid: GCA 900110395 1
AAI clade 5 medoid: GCA 012798955 1
AAI clade 6 medoid: GCA 013415575 1
AAI clade 7 medoid: GCF 008638345 1
AAI clade 8 medoid: GCF 000807255 1
AAI clade 9 medoid: GCF 001050135 1
AAI clade 10 medoid: GCA 002717245 1
AAI clade 11 medoid: GCA 017478625 1
AAI clade 12 medoid: GCA 009773355 1
AAI clade 13 medoid: GCA 905200435 1
AAI clade 14 medoid: GCA 017516885 1
AAI clade 15 medoid: GCA 004321885 1
AAI clade 16 medoid: GCA 905236305 1
AAI clade 17 medoid: GCA 017648525 1
AAI clade 18 medoid: GCA 019113065 1
AAI clade 19 medoid: GCA 016795075 1
AAI clade 20 medoid: GCF 001467025 1
AAI clade 21 medoid: GCA 017642855 1
AAI clade 22 medoid: GCA 017408305 1
AAI clade 23 medoid: GCA 002436405 1

AAI-based medoid clustering

A collaboration between