AAI-based medoid clustering

The AAI clusters provide a good overview of the above-species structure of the datasets and facilitate taxonomic classification.

• AAI clade 1 medoid: GCA 017502845 1
  • AAI clade 1-1 medoid: GCA 900546775 1
    • AAI clade 1-1-1 medoid: GCF 010509075 1
      • AAI clade 1-1-1-1 medoid: GCF 010509075 1
        • AAI clade 1-1-1-1-1 medoid: GCA 900546775 1
          • AAI clade 1-1-1-1-1-1 medoid: GCA 900541125 1
          • AAI clade 1-1-1-1-1-2 medoid: GCA 900546775 1
          • AAI clade 1-1-1-1-1-3 medoid: GCA 900547805 1
            • AAI clade 1-1-1-1-1-3-1 medoid: GCA 900552185 1
            • AAI clade 1-1-1-1-1-3-2 medoid: GCA 002437815 1
            • AAI clade 1-1-1-1-1-3-3 medoid: GCA 900547805 1
              • AAI clade 1-1-1-1-1-3-3-1 medoid: GCA 018368345 1
              • AAI clade 1-1-1-1-1-3-3-2 medoid: GCA 900539035 1
              • AAI clade 1-1-1-1-1-3-3-3 medoid: GCA 900540895 1
              • AAI clade 1-1-1-1-1-3-3-4 medoid: GCA 900540905 1
              • AAI clade 1-1-1-1-1-3-3-5 medoid: GCA 900540995 1
              • AAI clade 1-1-1-1-1-3-3-6 medoid: GCA 900541135 1
              • AAI clade 1-1-1-1-1-3-3-7 medoid: GCA 900541665 1
              • AAI clade 1-1-1-1-1-3-3-8 medoid: GCA 900542085 1
              • AAI clade 1-1-1-1-1-3-3-9 medoid: GCA 900542235 1
              • AAI clade 1-1-1-1-1-3-3-10 medoid: GCA 900542275 1
              • AAI clade 1-1-1-1-1-3-3-11 medoid: GCA 900542825 1
              • AAI clade 1-1-1-1-1-3-3-12 medoid: GCA 900547805 1
              • AAI clade 1-1-1-1-1-3-3-13 medoid: GCA 900544205 1
              • AAI clade 1-1-1-1-1-3-3-14 medoid: GCA 900548515 1
              • AAI clade 1-1-1-1-1-3-3-15 medoid: GCA 900548815 1
              • AAI clade 1-1-1-1-1-3-3-16 medoid: GCA 900549185 1
              • AAI clade 1-1-1-1-1-3-3-17 medoid: GCA 900550185 1
              • AAI clade 1-1-1-1-1-3-3-18 medoid: GCA 900551605 1
                1 dataset: GCA 900551605 1 (AAI: 100.0%)
              • AAI clade 1-1-1-1-1-3-3-19 medoid: GCA 900553475 1
              • AAI clade 1-1-1-1-1-3-3-20 medoid: GCA 900556605 1
              • AAI clade 1-1-1-1-1-3-3-21 medoid: GCA 900754275 1
              • AAI clade 1-1-1-1-1-3-3-22 medoid: GCA 900757185 1
              • AAI clade 1-1-1-1-1-3-3-23 medoid: GCA 900757465 1
              • AAI clade 1-1-1-1-1-3-3-24 medoid: GCA 900757495 1
              • AAI clade 1-1-1-1-1-3-3-25 medoid: GCA 900757595 1
              • AAI clade 1-1-1-1-1-3-3-26 medoid: GCA 900757615 1
              • AAI clade 1-1-1-1-1-3-3-27 medoid: GCA 900759335 1
              • AAI clade 1-1-1-1-1-3-3-28 medoid: GCA 900760325 1
              • AAI clade 1-1-1-1-1-3-3-29 medoid: GCA 900764955 1
              • AAI clade 1-1-1-1-1-3-3-30 medoid: GCA 900765115 1
              • AAI clade 1-1-1-1-1-3-3-31 medoid: GCA 900766165 1
              • AAI clade 1-1-1-1-1-3-3-32 medoid: GCF 003459505 1
              • AAI clade 1-1-1-1-1-3-3-33 medoid: GCF 003462685 1
            • AAI clade 1-1-1-1-1-3-4 medoid: GCA 900541195 1
            • AAI clade 1-1-1-1-1-3-5 medoid: GCA 900541745 1
            • AAI clade 1-1-1-1-1-3-6 medoid: GCA 900548265 1
            • AAI clade 1-1-1-1-1-3-7 medoid: GCA 900549275 1
            • AAI clade 1-1-1-1-1-3-8 medoid: GCA 900549455 1
            • AAI clade 1-1-1-1-1-3-9 medoid: GCA 900554325 1
            • AAI clade 1-1-1-1-1-3-10 medoid: GCA 900554465 1
            • AAI clade 1-1-1-1-1-3-11 medoid: GCA 900555765 1
            • AAI clade 1-1-1-1-1-3-12 medoid: GCA 900556675 1
        • AAI clade 1-1-1-1-2 medoid: GCA 900554645 1
      • AAI clade 1-1-1-2 medoid: GCF 002159765 1
    • AAI clade 1-1-2 medoid: GCF 012027725 1
    • AAI clade 1-1-3 medoid: GCA 900551665 1
    • AAI clade 1-1-4 medoid: GCA 015258605 1
  • AAI clade 1-2 medoid: GCA 905221215 1
  • AAI clade 1-3 medoid: GCF 015326965 1
  • AAI clade 1-4 medoid: GCF 900094905 1
  • AAI clade 1-5 medoid: GCF 008764295 1
  • AAI clade 1-6 medoid: GCA 900551895 1
  • AAI clade 1-7 medoid: GCF 009193305 1
  • AAI clade 1-8 medoid: GCA 017503135 1
  • AAI clade 1-9 medoid: GCA 900552565 1
  • AAI clade 1-10 medoid: GCA 017411305 1
  • AAI clade 1-11 medoid: GCF 001465345 1
  • AAI clade 1-12 medoid: GCA 900759455 1
  • AAI clade 1-13 medoid: GCF 015207245 1
  • AAI clade 1-14 medoid: GCA 017960805 1
  • AAI clade 1-15 medoid: GCA 001604115 1
  • AAI clade 1-16 medoid: GCA 900551775 1
  • AAI clade 1-17 medoid: GCA 016929555 1
  • AAI clade 1-18 medoid: GCF 004770145 1
  • AAI clade 1-19 medoid: GCF 004745505 1
  • AAI clade 1-20 medoid: GCA 900761225 1
  • AAI clade 1-21 medoid: GCA 900556695 1
  • AAI clade 1-22 medoid: GCA 017504995 1
  • AAI clade 1-23 medoid: GCA 900550055 1
  • AAI clade 1-24 medoid: GCA 017464135 1
  • AAI clade 1-25 medoid: GCA 014860805 1
• AAI clade 2 medoid: GCA 002434265 1
• AAI clade 3 medoid: GCA 013002175 1
• AAI clade 4 medoid: GCA 900110395 1
• AAI clade 5 medoid: GCA 012798955 1
• AAI clade 6 medoid: GCA 013415575 1
• AAI clade 7 medoid: GCF 008638345 1
• AAI clade 8 medoid: GCF 000807255 1
• AAI clade 9 medoid: GCF 001050135 1
• AAI clade 10 medoid: GCA 002717245 1
• AAI clade 11 medoid: GCA 017478625 1
• AAI clade 12 medoid: GCA 009773355 1
• AAI clade 13 medoid: GCA 905200435 1
• AAI clade 14 medoid: GCA 017516885 1
• AAI clade 15 medoid: GCA 004321885 1
• AAI clade 16 medoid: GCA 905236305 1
• AAI clade 17 medoid: GCA 017648525 1
• AAI clade 18 medoid: GCA 019113065 1
• AAI clade 19 medoid: GCA 016795075 1
• AAI clade 20 medoid: GCF 001467025 1
• AAI clade 21 medoid: GCA 017642855 1
• AAI clade 22 medoid: GCA 017408305 1
• AAI clade 23 medoid: GCA 002436405 1