AAI-based medoid clustering

The AAI clusters provide a good overview of the above-species structure of the datasets and facilitate taxonomic classification.

• AAI clade 1 medoid: GCA 017502845 1
  • AAI clade 1-1 medoid: GCA 900546775 1
    • AAI clade 1-1-1 medoid: GCF 010509075 1
      • AAI clade 1-1-1-1 medoid: GCF 010509075 1
        • AAI clade 1-1-1-1-1 medoid: GCA 900546775 1
          • AAI clade 1-1-1-1-1-1 medoid: GCA 900541125 1
          • AAI clade 1-1-1-1-1-2 medoid: GCA 900546775 1
            • AAI clade 1-1-1-1-1-2-1 medoid: GCA 900546775 1
              • AAI clade 1-1-1-1-1-2-1-1 medoid: GCA 900546775 1
                • AAI clade 1-1-1-1-1-2-1-1-1 medoid: GCA 900546775 1
                  • AAI clade 1-1-1-1-1-2-1-1-1-1 medoid: GCA 900546775 1
                    • AAI clade 1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-1 medoid: GCA 900768435 1
                    • AAI clade 1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-2 medoid: GCA 900540875 1
                    • AAI clade 1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-3 medoid: GCA 900541475 1
                    • AAI clade 1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-4 medoid: GCA 900541645 1
                    • AAI clade 1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-5 medoid: GCA 900542155 1
                    • AAI clade 1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-6 medoid: GCA 900542175 1
                    • AAI clade 1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-7 medoid: GCA 900542325 1
                    • AAI clade 1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-8 medoid: GCA 900542555 1
                    • AAI clade 1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-9 medoid: GCA 900544115 1
                    • AAI clade 1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-10 medoid: GCA 900545555 1
                    • AAI clade 1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-11 medoid: GCA 900545995 1
                    • AAI clade 1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-12 medoid: GCA 900546825 1
                    • AAI clade 1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-13 medoid: GCA 900547765 1
                    • AAI clade 1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-14 medoid: GCA 900547835 1
                    • AAI clade 1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-15 medoid: GCA 900548075 1
                    • AAI clade 1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-16 medoid: GCA 900549195 1
                    • AAI clade 1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-17 medoid: GCA 900549345 1
                    • AAI clade 1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-18 medoid: GCA 900549355 1
                    • AAI clade 1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-19 medoid: GCA 900550415 1
                    • AAI clade 1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-20 medoid: GCA 900550835 1
                    • AAI clade 1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-21 medoid: GCA 900551015 1
                    • AAI clade 1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-22 medoid: GCA 900552145 1
                    • AAI clade 1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-23 medoid: GCA 900552705 1
                    • AAI clade 1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-24 medoid: GCA 900555515 1
                    • AAI clade 1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-25 medoid: GCA 900752425 1
                    • AAI clade 1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-26 medoid: GCA 900755005 1
                    • AAI clade 1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-27 medoid: GCA 900756725 1
                    • AAI clade 1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-28 medoid: GCA 900756765 1
                      1 dataset: GCA 900756765 1 (AAI: 100.0%)
                    • AAI clade 1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-29 medoid: GCA 900757705 1
                    • AAI clade 1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-30 medoid: GCA 900761145 1
                    • AAI clade 1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-31 medoid: GCA 900761995 1
                    • AAI clade 1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-32 medoid: GCA 900762355 1
                    • AAI clade 1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-33 medoid: GCA 900765185 1
                    • AAI clade 1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-34 medoid: GCA 900768265 1
                    • AAI clade 1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-35 medoid: GCA 902406155 1
                    • AAI clade 1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-36 medoid: GCA 902835305 1
                    • AAI clade 1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-37 medoid: GCA 905214905 1
                    • AAI clade 1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-38 medoid: GCF 001404695 1
                    • AAI clade 1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-39 medoid: GCF 002736145 1
                    • AAI clade 1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-40 medoid: GCF 003439125 1
                    • AAI clade 1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-41 medoid: GCF 009876115 1
                    • AAI clade 1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-42 medoid: GCF 015554145 1
                    • AAI clade 1-1-1-1-1-2-1-1-1-1-43 medoid: GCF 015561195 1
                  • AAI clade 1-1-1-1-1-2-1-1-1-2 medoid: GCA 900551635 1
                  • AAI clade 1-1-1-1-1-2-1-1-1-3 medoid: GCA 900552995 1
                  • AAI clade 1-1-1-1-1-2-1-1-1-4 medoid: GCA 902388345 1
                • AAI clade 1-1-1-1-1-2-1-1-2 medoid: GCA 900757265 1
              • AAI clade 1-1-1-1-1-2-1-2 medoid: GCA 900554655 1
            • AAI clade 1-1-1-1-1-2-2 medoid: GCF 010509075 1
          • AAI clade 1-1-1-1-1-3 medoid: GCA 900547805 1
        • AAI clade 1-1-1-1-2 medoid: GCA 900554645 1
      • AAI clade 1-1-1-2 medoid: GCF 002159765 1
    • AAI clade 1-1-2 medoid: GCF 012027725 1
    • AAI clade 1-1-3 medoid: GCA 900551665 1
    • AAI clade 1-1-4 medoid: GCA 015258605 1
  • AAI clade 1-2 medoid: GCA 905221215 1
  • AAI clade 1-3 medoid: GCF 015326965 1
  • AAI clade 1-4 medoid: GCF 900094905 1
  • AAI clade 1-5 medoid: GCF 008764295 1
  • AAI clade 1-6 medoid: GCA 900551895 1
  • AAI clade 1-7 medoid: GCF 009193305 1
  • AAI clade 1-8 medoid: GCA 017503135 1
  • AAI clade 1-9 medoid: GCA 900552565 1
  • AAI clade 1-10 medoid: GCA 017411305 1
  • AAI clade 1-11 medoid: GCF 001465345 1
  • AAI clade 1-12 medoid: GCA 900759455 1
  • AAI clade 1-13 medoid: GCF 015207245 1
  • AAI clade 1-14 medoid: GCA 017960805 1
  • AAI clade 1-15 medoid: GCA 001604115 1
  • AAI clade 1-16 medoid: GCA 900551775 1
  • AAI clade 1-17 medoid: GCA 016929555 1
  • AAI clade 1-18 medoid: GCF 004770145 1
  • AAI clade 1-19 medoid: GCF 004745505 1
  • AAI clade 1-20 medoid: GCA 900761225 1
  • AAI clade 1-21 medoid: GCA 900556695 1
  • AAI clade 1-22 medoid: GCA 017504995 1
  • AAI clade 1-23 medoid: GCA 900550055 1
  • AAI clade 1-24 medoid: GCA 017464135 1
  • AAI clade 1-25 medoid: GCA 014860805 1
• AAI clade 2 medoid: GCA 002434265 1
• AAI clade 3 medoid: GCA 013002175 1
• AAI clade 4 medoid: GCA 900110395 1
• AAI clade 5 medoid: GCA 012798955 1
• AAI clade 6 medoid: GCA 013415575 1
• AAI clade 7 medoid: GCF 008638345 1
• AAI clade 8 medoid: GCF 000807255 1
• AAI clade 9 medoid: GCF 001050135 1
• AAI clade 10 medoid: GCA 002717245 1
• AAI clade 11 medoid: GCA 017478625 1
• AAI clade 12 medoid: GCA 009773355 1
• AAI clade 13 medoid: GCA 905200435 1
• AAI clade 14 medoid: GCA 017516885 1
• AAI clade 15 medoid: GCA 004321885 1
• AAI clade 16 medoid: GCA 905236305 1
• AAI clade 17 medoid: GCA 017648525 1
• AAI clade 18 medoid: GCA 019113065 1
• AAI clade 19 medoid: GCA 016795075 1
• AAI clade 20 medoid: GCF 001467025 1
• AAI clade 21 medoid: GCA 017642855 1
• AAI clade 22 medoid: GCA 017408305 1
• AAI clade 23 medoid: GCA 002436405 1